Update Artikelilmiah: 32203

RADIKTYA SURYA PRADANA

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Latar Belakang: Dalam pengembangan obat antikanker, epidermal growth factor
receptor (EGFR) telah terbukti menjadi target yang layak untuk dilakukan studi
lebih lanjut. Salah satu pendekatan terapi dengan target EGFR yang dapat
digunakan yaitu inhibitor tirosin kinase. Senyawa flavonoid dilaporkan berpotensi
sebagai inhibitor tirosin kinase. Penelitian ini bertujuan untuk mencari senyawa
turunan flavonoid dari genus Artocarpus sebagai inhibitor EGFR akibat adanya
perkembangan mutasi pada EGFR.
Metodologi: Virtual skrining terhadap inhibitor tirosin kinase dengan target protein
EGFRL858R/T790M (PDB ID :6JX4) dilakukan melalui metode penambatan molekul dengan kontrol obat osimertinib dan olmutinib. Preparasi protein dengan
menghilangkan molekul air dan memisahkan molekul reseptor dan ligan natif
dalam file PDB terpisah. Reseptor ditambatkan dengan ligan natif dan mendapatkan koordinat grid box. Nilai RMSD ditentukan dari hasil penambatan tersebut. Penambatan senyawa uji dengan reseptor dilakukan menggunakan koordinat hasil validasi yang valid. Konformasi dengan energi terendah divisualisasi
Hasil Penelitian: Validasi menunjukkan nilai RSMD yaitu 1.97 Å. Energi ikatan
terendah yaitu -10,0 kkal/mol untuk senyawa ACP35 sedangkan untuk kontrol
olmutinib dan osimertinib masing masing adalah -8,2 kkal/mold an -7,2 kkal/mol
Hasil visualisasi pada senyawa ACP35 menunjukkan ikatan hidrogen terhadap
LYS745 dengan jarak 3,17Å; ikatan hidrofobik meliputi pi-sigma (LEU718,
VAL726), alkil (MET790, VAL726, LEU718, LYS745), pi-alkyl (ALA743,
LEU844, LEU718); dan interaksi akseptor-akseptor (MET793)
Kesimpulan: Senyawa ACP35 berpotensi sebagai inhibitor EGFR.

Abtrak (Bhs. Inggris)

Backgrounds: In the development of anticancer drugs, epidermal growth factor
receptor (EGFR) has proven as an excellent target. Flavonoid compounds have been reported as potential tyrosine kinase inhibitors. This study aims to find Flavonoid derivatives from the genus Artocarpus as EGFR inhibitors due to the development of mutations in EGFR
Methods: Virtual screening for tyrosine kinase inhibitors targeting the protein
EGFRL858R / T790M (PDB ID: 6JX4) was carried out through the molecular docking method with the control drugs osimertinib and olmutinib. Protein preparations were treated by removing the water molecule and separating receptor molecules. The receptors attached with a native ligand and grid box coordinates were obtained. The RMSD value was determined from the results of the docking. The docking of 59 datasets to the receptor was carried out using validation coordinates before. The conformation with the lowest energy was visualized
Results: The result of validation shows that the RSMD value is 1.97 Å. The lowest
bond energy is -10.0 kcal/mol for ACP35 compound while for olmutinib and osimertinib control is -8.2 kcal/mol and -7.2 kcal/mol respectively. Visualization results on ACP35 compounds show hydrogen bond interaction to LYS745 with a
distance 3.17Å; then hydrophobic bonds include pi-sigma (LEU718, VAL726), alkyl (MET790, VAL726, LEU718, LYS745), pi-alkyl (ALA743, LEU844, LEU718); and acceptor-acceptor interactions (MET793).
Conclusion: ACP35 compound has the potential as an EGFR inhibitor

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman