| NIM | A1L010138 |
|---|
| Namamhs | RIZAL ANDI SYA'BANA |
|---|
| Judul Artikel | Kekerabatan Padi-Padi Toleran Salin berdasarkan Mikrosatelit DNA |
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Karakterisasi varietas padi toleran salin sangat penting untuk memudahkan seleksi dalam program pemuliaan padi. Marka molekuler tidak terpengaruh oleh faktor lingkungan sehingga efektif untuk menyeleksi true-genotype. Di antara marka-marka molekuler yang ada, mikrosatelit DNA atau sering disebut simple sequence repeat (SSR) merupakan marka yang banyak digunakan dalam program MAS. Mikrosatelit adalah sekuen DNA dengan motif urutan basa yang sederhana dan berulang. Marka molekuler telah digunakan dalam program Molecular Assisted Selection (MAS) karena kelebihannya dibanding marka fisiologis dan atau agronomis. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk: 1) mengidentifikasi mikrosatelit DNA yang polimorfik pada genotip padi yang diuji; dan 2) mengetahui kekerabatan antar genotip padi toleran salin yang diuji. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Pemuliaan Tanaman dan Bioteknologi, Fakultas Pertanian, Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto. Penelitian dilaksanakan dari Maret 2014 hingga Agustus 2014. Penelitian ini menggunakan delapan primer (forward dan reverse) mikrosatelit dan 22 genotip padi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa lima dari delapan primer yang diuji (RM224, RM225, RM342, RM426 dan RM 528) menghasilkan pola pita DNA yang polimorfik pada populasi yang diuji dengan nilai rata-rata PIC (Polimorphic Information Content) 0,43. Analisis filogenetik berdasarkan lima marka yang polimorfik menunjukkan bahwa genotip-genotip yang diuji terbagi menjadi 14 kluster. |
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Characterization of saline tolerant rice varieties is important to facilitate effective selection in rice breeding program. Molecular marker is not influenced by environmental factor such that it is effective to select true-genotype. Among the known molecular markers, microsatellite DNA or simple sequence repeat (SSR) is widely used in MAS program. Microsatellite is a simple sequence of DNA with a repetitive motive. Molecular markers have been used in Molecular Assisted Selection (MAS) programs because of its advantages compared with physiological and or agronomic markers. The objectives of this research were to: 1) identify polymorphic microsatellite DNA on tested saline tolerant rice genotypes; and 2) determine the phylogenetic relationship of the tested saline tolerant rice genotypes. This research was conducted in Laboratory of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Jenderal Soedirman University, Purwokerto started from March to August 2014. In this study, eight microsatellites primers (forward and reverse) were used to amplify microsatellites of DNA templates of 22 rice genotypes. The results showed that five out of eight primers (RM224, RM225, RM342, RM426 and RM528) generated polymorphic DNA banding pattern on the tested genotypes with an average value of PIC (Polimorphic Information Content) of 0.43. The phylogenetic analysis showed that the tested genotypes may be grouped into 14 clusters. |
|---|
| Kata kunci | padi toleran salin, marka molekuler, mikrosatelit, filogenetik. |
|---|
| Pembimbing 1 | Ir. Suprayogi, M.Sc., Ph.D |
|---|
| Pembimbing 2 | Prita Sari Dewi, S.P.,M.Sc.,Ph.D |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2014 |
|---|
| Jumlah Halaman | 11 |
|---|
| Tgl. Entri | 2014-11-15 12:11:30.679576 |
|---|