Artikel Ilmiah : A1L009153 a.n. AMRIH SUSETIYO
| NIM | A1L009153 |
|---|---|
| Namamhs | AMRIH SUSETIYO |
| Judul Artikel | ANALISIS GENETIK PADI AROMATIK DAN NON AROMATIK MENGGUNAKAN MARKA MIKROSATELIT |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Penelitian ini bertujuan antara lain untuk: 1) mengetahui karakter molekuler sifat aromatik dengan marka mikrosatelit, 2) mengetahui primer yang spesifik untuk pencirian karakter genotipe sifat aromatik dan non aromatik berdasarkan pola pita DNA mikrosatelit, 3) mengetahui kekerabatan antar varietas dan galur padi yang dicoba dalam penelitian ini. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Riset dan Laboratorium Pemuliaan Tanaman dan Bioteknologi, Fakultas Pertanian, Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto. Penelitian dilaksanakan dari bulan Oktober 2012 sampai September 2013. Penelitian ini menggunakan 14 primer mikrosatelit dan 14 genotipe padi. Variabel yang diamati adalah keberadaan pita DNA yang teramplifikasi pada masing-masing sampel, analisis tingkat polimorfisme (PIC), dan analisis filogenetik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 9 primer bersifat monomorfis dan 5 primer bersifat polimorfis dengan nilai PIC rata-rata 0.28 (kategori informatif sedang), belum ditemukan primer yang bersifat spesifik untuk pembeda sifat padi aromatik dan non aromatik (primer RM426 dan RM444 mendekati spesifik), dan dendogram memperlihatkan bahwa genotipe yang dievaluasi terbagi dalam V (lima) klaster dan memiliki tingkat kekerabatan yang bervariasi. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | This research was aimed to: 1) know the aromatic molecular character with microsatellite marker; 2) know the specific primers for characterization of genotype aromatic and non-aromatic character based on microsatellite DNA banding pattern; 3) know the genetic relationship between varieties and rice lines that were tested in this research. The research was conducted at the Laboratory of Riset and the Laboratory of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Jenderal Soedirman University, Purwokerto. The experiment was conducted from October 2012 to September 2013. This research used 14 microsatellite primer and 14 genotypes of rice. The observed variable were presence of DNA bands that was amplified on each sample, polymorphism informaion content (PIC) level analysis, and phylogenetic analysis. The results showed that 9 primers was monomorphism and 5 primars was polymorphism with the average PIC value was 0.28 (informative medium category), has not found yet the primers that specific for distinguished aromatic and non-aromatic rice (RM426 and RM444 primers were near specific), and dendogram showed that evaluated genotype was divided in to V ( five ) clusters and has a variety of a genetic similarity level. |
| Kata kunci | Mikrosatelit, padi aromatik, marka molekuler, analisis genetik |
| Pembimbing 1 | Ir. Suprayogi, M.Sc., Ph.D. |
| Pembimbing 2 | Ir. Budi Prakoso, M.Sc., D.Tech.Sc. |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2014 |
| Jumlah Halaman | 14 |
| Tgl. Entri | (belum diset) |