Artikel Ilmiah : B1J009187 a.n. AYU RAHAYU
| NIM | B1J009187 |
|---|---|
| Namamhs | AYU RAHAYU |
| Judul Artikel | ANALISIS FILOGENETIK 16S rDNA BAKTERI PENDEGRADASI SENYAWA XENOBIOTIK DARI MANGROVE TIRITIH KULON CILACAP |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Senyawa xenobiotik merupakan senyawa asing yang dapat mencemari lingkungan. Beberapa bakteri memiliki kemampuan dalam mendegradasi senyawa xenobiotik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui jenis bakteri indigenous berdasarkan identifikasi secara molekuler yang mampu mendegradasi senyawa pencemar xenobiotik yaitu solar, pewarna tekstil, dan deterjen dari mangrove Tiritih Kulon, Cilacap dan menentukan hubungan kekerabatannya berdasarkan sekuensing gen 16S rDNA. Penelitian ini menggunakan metode deskriptif. Parameter yang digunakan yaitu panjang pita hasil amplifikasi DNA, persen homologi spesies bakteri, dan hasil konstruksi filogenetik berdasarkan jarak genetik. Data dianalisis menggunakan metode deksriptif komparatif. Hasil penelitian menunjukkan bahwa DNA teramplifikasi menggunakan 16S rDNA. Isolat bakteri yang teridentifikasi memiliki kesamaan homologi dengan bakteri dari genus Vibrio, Orchobactrum, Pseudomonas, Bacillus, dan Acinetobacter. Analisis hubungan filogenetik antara isolat bakteri dengan data GenBank adalah terbentuk dua klaster menggunakan 16S rDNA dengan jarak genetik yang bervariasi. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Xenobiotic compounds are a foreign compound that capable of contaminating the environment. Some bacteria have the ability to degrade xenobiotic compound. The aims of this research were to know the kinds of indigenous bacteria based on molecular identification that capable of degrading xenobiotic compound such as solar, textile dye, and detergent from Tiritih Kulon Mangrove, Cilacap and to determine their genetic relationship based on 16S rDNA sequence. The descriptive method was used in this research. As parameters, long fragments DNA amplification, percent homologous bacterial species, and phylogenetic construction based on genetic distance were recorded. The obtained data were analyzed by comparative descriptive method. The result of this research showed that DNA was amplified by 16S rDNA. Bacterial isolated were identified as having homology similarities with bacteria from genus Vibrio, Orchobactrum, Pseudomonas, Bacillus, and Acinetobacteria. The phylogenetic relationship analysis between bacterial isolates and GenBank data are maked two cluster by 16S rDNA with varied of genetic distances. |
| Kata kunci | bakteri, xenobiotik, 16S rDNA, filogenetik |
| Pembimbing 1 | Prof. Drs. Agus Irianto, M.Sc, Ph.D. |
| Pembimbing 2 | Dr. Hendro Pramono, M.S. |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2013 |
| Jumlah Halaman | 10 |
| Tgl. Entri | (belum diset) |