| NIM | B1A022103 |
|---|
| Namamhs | KHUSUWARINI |
|---|
| Judul Artikel | Karakterisasi Morfologi dan Profil RAPD pada Empat Spesies Kantong Semar (Nepenthes spp.)
|
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Kantong semar (Nepenthes spp.) merupakan tumbuhan karnivora yang keberadaannya dilindungi di dunia karena terancam punah akibat kerusakan habitat dan eksploitasi berlebihan. Sebanyak 80 spesies kantong semar dari total 181 spesies yang dilaporkan di dunia terdapat di Indonesia sehingga pendataan karakteristik setiap spesies sangat penting dilakukan untuk mendukung upaya konservasi. Identifikasi variasi intraspesies maupun perbedaan genetik interspesies sulit dilakukan jika hanya didasarkan pada karakter morfologi karena karakter tersebut sangat dipengaruhi oleh lingkungan dan tahap perkembangan tanaman.Oleh sebab itu, diperlukan pendekatan molekuler untuk mendapatkan informasi genetik yang lebih akurat. Salah satu penanda yang sering digunakan dalam studi genom tanaman adalah RAPD. Penggunaan penanda RAPD dipilih karena dianggap efektif, cepat, mudah, dan tidak memerlukan informasi sekuens DNA target. Integrasi analisis morfologi dan molekuler diharapkan dapat menghasilkan data yang lebih akurat dalam mendeteksi variasi intraspesies dan perbedaan genetik interspesies kantong semar. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perbedaan karakter morfologi dan profil RAPD antar spesies kantong semar (N. ampullaria, N. mirabilis, N. gracilis, dan N. reinwardtiana), mengkaji keanekaragaman morfologi dan profil RAPD intraspesies, serta menentukan hubungan kekerabatan antar keempat spesies kantong semar tersebut.Penelitian dilakukan di Green House dan Laboratorium Genetika dan Molekuler Fakultas Biologi, serta di Laboratorium Riset Terpadu Universitas Jenderal Soedirman. Di dalam penelitian ini, digunakan pendekatan deskriptif dengan mengambil sampel koleksi Nepenthes yang dibudidayakan di Green House. Analisis data karakter morfologi kualitatif dilakukan secara deksriptif, kemudian dilakukan rekonstruksi fenogram menggunakan perangkat lunak MVSP 3.2. Data morfologi kuantitatif dilakukan uji ANOVA pada data yang terdistribusi normal, dan uji Kruskall-Wallis pada data yang terdistribusi tidak normal. Sementara itu profil pita DNA dikonversi menjadi data biner, kemudian dianalisis menggunakan perangkat lunak MVSP 3.2 untuk membangun fenogram yang menggambarkan hubungan genetik antar keempat spesies kantong semar. Hasil penelitian menunjukkan perbedaan karakter morfologi antar spesies dapat dilihat dari bentuk dan permukaan beberapa organnya sedangkan RAPD mampu mendeteksi perbedaan genetik interspesies dan menghasilkan 53 fragmen DNA dengan tingkat polimorfisme total sebesar 96,23%. Keanekaragaman morfologi intraspesies dapat dilihat dari variasi warna tiap organ dari individu sejenis sedangkan profil RAPD mampu mendeteksi keanekaragaman intraspesies dan menghasilkan Nepenthes gracilis sebagai spesies dengan polimorfisme tertinggi dan N. reinwardtiana dengan polimorfisme terendah. Analisis hubungan kekerabatan berdasarkan morfologi menunjukkan Nepenthes ampullaria sebagai kerabat terjauh dari ketiga spesies lainnya sedangkan analisis kekerabatan menurut profil RAPD menunjukkan Nepenthes gracilis sebagai kerabat terjauhnya. |
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Pitcher plants (Nepenthes spp.) are carnivorous plants protected globally due to the threat of extinction caused by habitat destruction and over-exploitation. A total of 80 pitcher plant species out of the 181 species reported worldwide are found in Indonesia; therefore, documenting the characteristics of each species is crucial to support conservation efforts. Identifying intraspecific variation and interspecific genetic differences is difficult if based solely on morphological traits, as these traits are heavily influenced by the environment and the plant’s developmental stage. Therefore, a molecular approach is needed to obtain more accurate genetic information. One of the markers frequently used in plant genomics studies is RAPD. RAPD markers were chosen because they are considered effective, rapid, easy to use, and do not require target DNA sequence information. The integration of morphological and molecular analyses is expected to yield more accurate data for detecting intraspecific variation and interspecific genetic differences in pitcher plants. This study aims to identify differences in morphological characteristics and RAPD profiles among pitcher plant species (N. ampullaria, N. mirabilis, N. gracilis, and N. reinwardtiana), examine intraspecific morphological and RAPD profile diversity, and determine the phylogenetic relationships among these four pitcher plant species. The research was conducted at the Green house and the Genetics and Molecular Biology Laboratory of the Faculty of Biology, as well as at the Integrated Research Laboratory of Jenderal Soedirman University. In this study, a descriptive approach is employed, with samples collected from the Nepenthes collection cultivated in the Green house. Qualitative morphological data were analyzed descriptively and a dendrogram was reconstructed using MVSP 3.2 software. Quantitative morphological data were analyzed using ANOVA for normally distributed data and the Kruskal-Wallis test for non-normally distributed data. Meanwhile, DNA band profiles were converted into binary data and then analyzed using MVSP 3.2 software to construct a dendrogram illustrating the genetic relationships among the four pitcher plant species. The results showed that morphological differences between species could be observed in the shape and texture from surface of certain organs, whereas RAPD analysis successfully detected interspecific genetic variation and generated 53 DNA fragments with an overall polymorphism level of 96.23%. Intraspecific morphological variation was reflected in differences in the color and size of plant organs among individuals of the same species. RAPD analysis also detected intraspecific genetic variation, with Nepenthes gracilis exhibiting the highest level of polymorphism and N. reinwardtiana the lowest. Phylogenetic analysis based on morphology indicates that Nepenthes ampullaria is the most distantly related to the other three species, whereas phylogenetic analysis based on RAPD profiles indicates that Nepenthes gracilis is the most distantly related. |
|---|
| Kata kunci | kantong semar, keanekaragaman genetik, morfologi, RAPD |
|---|
| Pembimbing 1 | Ir. Alice Yuniaty, M.Sc., Ph.D. |
|---|
| Pembimbing 2 | Prof. Dr. Murni Dwiati, M.Si |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2026 |
|---|
| Jumlah Halaman | 71 |
|---|
| Tgl. Entri | 2026-08-24 10:32:05.365725 |
|---|