Artikel Ilmiah : B1A022106 a.n. GITTA ARDELIA PUTRI
| NIM | B1A022106 |
|---|---|
| Namamhs | GITTA ARDELIA PUTRI |
| Judul Artikel | Karakterisasi Morfologi dan Analisis RAPD pada Tanaman Nepenthes mirabilis dan Nepenthes rafflesiana |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Nepenthes merupakan tanaman karnivora yang memiliki struktur berupa kantong untuk menangkap mangsa sebagai sumber nutrisi tambahan dan adaptasi terhadap lingkungan miskin nitrogen. Indonesia memiliki lebih dari 80 spesies Nepenthes, tetapi banyak di antaranya berada dalam kondisi terancam akibat degradasi habitat, kebakaran, serta alih fungsi lahan. Dalam upaya konservasi populasi yang makin menurun, ketepatan identifikasi spesies menjadi aspek penting sebagai dasar pengelolaan. Identifikasi dapat dilakukan berbasis morfologi melalui pengamatan karakter vegetatif tanaman. Namun, spesies Nepenthes yang sama dapat menunjukkan variasi morfologi sehingga identifikasi berdasarkan karakter morfologi saja sering kali tidak cukup akurat karena dipengaruhi oleh kondisi lingkungan dan fase pertumbuhan tanaman. Oleh sebab itu, pendekatan molekuler seperti Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) diperlukan untuk menentukan perbedaan genetik secara lebih objektif. Penelitian ini bertujuan mengarakterisasi morfologi serta menganalisis profil RAPD pada tiga taksa, yaitu N. mirabilis var. mirabilis, N. mirabilis var. globosa, dan N. rafflesiana, guna mengetahui perbedaan genetik antartaksa, keanekaragaman intrataksa, dan hubungan genetik. Sampel Nepenthes diperoleh dari koleksi greenhouse Fakultas Biologi Universitas Jenderal Soedirman. Kajian dilakukan berdasarkan karakter morfologi secara kuantitatif dan kualitatif, serta analisis molekuler berbasis penanda RAPD. Karakter morfologi yang diamati meliputi batang, daun, sulur, dan kantong. Analisis molekuler dilakukan melalui ekstraksi DNA menggunakan metode CTAB, amplifikasi DNA dengan PCR RAPD, dan visualisasi fragmen DNA melalui elektroforesis. Data morfologi kualitatif dianalisis secara deskriptif, data morfologi kuantitatif dianalisis menggunakan Analisis Ragam (ANOVA) yang dilanjutkan dengan uji BNJ pada taraf 5%, sedangkan data RAPD dianalisis berdasarkan persentase polimorfisme dan hubungan genetik menggunakan metode UPGMA. Hasil analisis morfologi kualitatif menunjukkan bahwa N. rafflesiana memiliki perbedaan karakter pada daun dan kantong. Sementara itu, N. mirabilis var. mirabilis dan N. mirabilis var. globosa memiliki karakter batang dan daun yang serupa, tetapi berbeda pada morfologi kantong. Analisis morfologi kuantitatif menunjukkan bahwa hanya diameter batang yang berbeda nyata antartaksa. Analisis RAPD menghasilkan 40 fragmen DNA dengan persentase polimorfisme sebesar 80%. Berdasarkan analisis morfologi dan RAPD, seluruh sampel terkelompok ke dalam dua klaster utama, yaitu klaster N. rafflesiana dan klaster N. mirabilis, dengan klaster N. mirabilis terbagi menjadi dua subklaster, yaitu N. mirabilis var. mirabilis dan N. mirabilis var. globosa. Penelitian selanjutnya disarankan mengembangkan penanda molekuler berbasis Sequence Characterised Amplified Region (SCAR) untuk mendukung identifikasi genetik Nepenthes. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Nepenthes is a carnivorous plant that possesses specialized pitchers to capture prey as an additional nutrient source and as an adaptation to nitrogen-poor environments. Indonesia harbours more than 80 Nepenthes species, many of which are threatened by habitat degradation, forest fires, and land-use change. Accurate species identification is therefore essential to support conservation efforts. Morphological identification based on vegetative characters is commonly used. however, individuals of the same Nepenthes species may exhibit morphological variation influenced by environmental conditions and developmental stages, limiting the reliability of morphology alone. Therefore, molecular approaches such as Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) are required to provide a more objective assessment of genetic differences. This study aimed to characterize the morphology and analyse RAPD profiles of three Nepenthes taxa, namely N. mirabilis var. mirabilis, N. mirabilis var. globosa, and N. rafflesiana, in order to determine intertaxon genetic differences, intrataxon genetic diversity, and genetic relationships. Nepenthes samples were obtained from the greenhouse Collection of the Faculty of Biology, Universitas Jenderal Soedirman. The study was conducted using qualitative and quantitative morphological characterization and RAPD marker analysis. Morphological observations included stem, leaf, tendril, and pitcher characters. Molecular analysis involved DNA extraction using the CTAB method, RAPD-PCR amplification, and DNA fragment visualization by gel electrophoresis. Qualitative morphological data were analysed descriptively, whereas quantitative morphological data were analysed using analysis of variance (ANOVA) followed by Tukey's Honestly Significant Difference (HSD) test at the 5% significance level. RAPD data were analysed based on the percentage of polymorphism and genetic relationships using the UPGMA method. Qualitative morphological analysis revealed that N. rafflesiana differed from N. mirabilis in leaf and pitcher characteristics. In contrast, N. mirabilis var. mirabilis and N. mirabilis var. globosa exhibited similar stem and leaf characteristics but differed in pitcher morphology. Quantitative morphological analysis indicated that stem diameter was the only quantitative character that differed significantly among the taxa. RAPD analysis generated 40 DNA fragments with an overall polymorphism of 80%. Based on the combined morphological and RAPD analyses, all samples were classified into two major clusters, namely the N. rafflesiana cluster and the N. mirabilis cluster, with the latter further separated into two subclusters corresponding to N. mirabilis var. mirabilis and N. mirabilis var. globosa. Future studies are recommended to develop molecular markers using the Sequence Characterised Amplified Region (SCAR) approach to improve the genetic identification of Nepenthes. |
| Kata kunci | morfologi, Nepenthes, polimorfisme, RAPD, variasi genetik. |
| Pembimbing 1 | Ir. Alice Yuniaty, M.Sc., Ph.D. |
| Pembimbing 2 | Prof. Dr. Murni Dwiati, M.Si. |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2026 |
| Jumlah Halaman | 70 |
| Tgl. Entri | 2026-08-23 19:01:46.712179 |