Artikel Ilmiah : B1A022040 a.n. AHMAD FARIZAL
| NIM | B1A022040 |
|---|---|
| Namamhs | AHMAD FARIZAL |
| Judul Artikel | DETEKSI CEMARAN Listeria monocytogenes DALAM DAGING AYAM MENTAH DARI DUA PASAR TRADISIONAL BOGOR: STUDI KOMPARASI METODE qPCR DAN CULTURE-BASED |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Daging ayam memiliki peran penting dalam memenuhi kebutuhan gizi manusia. Daging tidak hanya kaya akan protein, daging ayam juga kaya akan asam amino esensial yang seimbang. Kandungan air yang tinggi, nitrogen, mineral, dan pH ideal membuat daging ayam dapat menjadi medium pertumbuhan yang cocok bagi mikroorganisme karena. Listeria monocytogenes merupakan salah satu penyebab listeriosis yang beresiko tinggi bagi kelompok rentan. Kontaminasi silang, penerapan zona hygiene atau sanitasi yang lemah serta kelembaban yang tinggi, dilaporkan menjadi faktor utama dalam penyebaran L. monocytogenes. Metode deteksi patogen ini umumnya menggunakan metode kultur mikrobiologi, namun metode ini memerlukan waktu yang cukup lama. Metode alternatif berupa qPCR memiliki kemampuan deteksi yang cepat, sensitif, dan akurat. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi cemaran L. monocytogenes pada daging ayam mentah yang dipasarkan di wilayah Bogor serta membandingkan sensitivitas metode dalam deteksi L. monocytogenes dengan qPCR dan culture-based method dalam daging ayam mentah. Metode pengambilan sampel yang digunakan yakni metode purposive sampling. Sampel yang digunakan dalam pegujian sensitivitas metode deteksi diperoleh dari pasar swalayan di Kota Bogor sedangkan sampel surveillance berasal dari 10 titik berbeda di dua pasar tradisional Bogor. Penelitian studi komparasi sensitivitas metode dialawai dengan homogenisasi sampel dengan medium enrichment dan dispiking 0,1 ml suspensi yang mengandung <10 CFU/ml L. monocytogenes. Enrichment dilakukan dengan waktu 2, 7, dan 12 jam dengan 5 kali pengulangan dan 1 kontrol negatif. Masing masing waktu enrichment dianalisis dengan metode qPCR dan culture-based. Variabel bebas meliputi lama waktu enrichment dan metode deteksi. Variabel terikat berupa hasil positif deteksi. Parameter yang diamati yakni nilai Ct pada metode qPCR dan pertumbuhan koloni pada culture-based. Data dianalisis dengan analisis Cohen Kappa yang merupakan ukuran statistik utntuk mengevaluasi hasil antara dua metode atau instrument pengukuran. Hasil penelitian menunjukkan bahwa waktu enrichment minimum untuk mendeteksi L. monocytogenes adalah 12 jam dengan metode yang paling sensitif adalah qPCR. Waktu enrichment ini seluruh sampel menunjukkan hasil positif yang ditandai dengan kenaikan kurva amplifikasi dibawah <40 siklus. Analisis kesesuaian metode menggunakan uji Cohen Kappa menghasilkan nilai k yang tidak dapat dihitung sehingga interpretasi didasarkan pada observed agreemnet yang berilai 1. Secara statistik nilai tersebut menunjukkan kesepakatan sempurna (Perfect agreement). Nilai tersebut mengindikasikan bahwa kedua metode dapat saling menggantikan dalam deteksi L. monocytogenes sesuai dengan kebutuhan analisis. Penerapan kedua metode terhadap sampel daging ayam yang diperoleh dari 10 titik berbeda di dua pasar tradisional di wilayah Bogor menunjukkan bahwa sampel daging ayam tidak terdapat cemaran L. monocytogenes. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Chicken meat plays an important role in fulfilling human nutritional needs. It is not only rich in protein but also contains a balanced composition of essential amino acids. However, meat can serve as an excellent medium for microbial growth due to its high waters content, nitrogen, minerals, and pH that supports the proliferation of various microorganisms. Listeria monocytogenes is one of the pathogenic bacteria responsible for listeriosis, which poses a high risk to vulnerable populations. Cross-contamination, inadequate hygiene and sanitation practices, and high humidity have been reported as the main factors contributing to the spread of L. monocytogenes. The detection of this pathogen is commonly performed using culture-based microbiological methods; however, these methods require a relatively long time. As an alternative, quantitative Polymerase Chain Reaction (qPCR) offers advantages in terms of speed, sensitivity, and accuracy. This study aimed to detect the presence of L. monocytogenes contamination in raw chicken meat marketed in the Bogor area and to compare the sensitivity of qPCR and culture-based methods in detecting this pathogen. The sampling method employed in this study was purposive sampling. Samples used for sensitivity testing were obtained from a supermarket in Bogor City, while surveillance samples were collected from 10 different points across two traditional markets in the Bogor area. The comparative sensitivity study was initiated by homogenizing the samples in an enrichment medium, followed by spiking with 0.1 mL of a suspension containing <10 CFU/mL of L. monocytogenes. The enrichment process was conducted for 2, 7, and 12 hours, with five replicates and one negative control. Each enrichment time was analyzed using both qPCR and culture-based methods. The independent variables included enrichment time and detection method, while the dependent variable was the detection result (positive or negative). The observed parameters were Ct values in qPCR and colony growth in the culture-based method. Data were analyzed using Cohen’s kappa analysis as a statistical measure to evaluate the agreement between the two methods. The results showed that the minimum enrichment time required to detect L. monocytogenes was 12 hours, with qPCR identified as the most sensitive method. At this enrichment time, all samples tested positive, indicated by the appearance of amplification curves below 40 cycles. The agreement analysis using Cohen’s kappa resulted in an undefined κ value; therefore, interpretation was based on the observed agreement value of 1, indicating perfect agreement. This result suggests that both methods produced fully consistent outcomes in detecting L. monocytogenes. The application of both methods to raw chicken meat samples collected from two traditional markets in Bogor revealed that no contamination of L. monocytogenes was detected in any of the samples. |
| Kata kunci | Comparation, Culture, Detection, qPCR |
| Pembimbing 1 | Dr. rer.nat. Saefuddin Aziz, S.Si., M.Si. |
| Pembimbing 2 | Dr. Priyo Wahyudi, M.Si. |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2026 |
| Jumlah Halaman | 44 |
| Tgl. Entri | 2026-04-10 09:01:27.180139 |