| NIM | B1B021008 |
|---|
| Namamhs | KHONSA TAQIYYAH |
|---|
| Judul Artikel | THE USE OF CHLOROPLAST GENOME MARKER IGS trnL (UAA) – trnF (GAA) IN DISTINGUISHING TWO CULTIVARS OF Rhynchostylis gigantea (Lindl.) Ridl. |
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Rhynchostylis gigantea (Lindl.) Ridl. adalah spesies anggrek yang menunjukkan variasi dalam pola dan warna bunga, khususnya peach dan putih. Sebagai spesies tanaman hias dengan nilai ekonomi tinggi, spesies ini sekarang terdaftar dalam Lampiran II CITES, terutama karena eksploitasi berlebihan dan sistem reproduksi yang rumit. Oleh karena itu, upaya konservasi genetik diperlukan, yang harus didahului dengan studi tentang keragaman genetik. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan urutan penanda molekuler IGS trnL (UAA) – trnF (GAA) pada dua kultivar yang berbeda dari R. gigantea dan untuk mengidentifikasi keberadaan perbedaan genetik antara kedua kultivar berdasarkan penanda molekuler tersebut. Hasil penelitian menunjukkan bahwa urutan IGS trnL(UAA)-trnF(GAA) sekitar 500 bp sebelum diedit dan 481 bp setelah diedit teramati. Semua enam urutan menunjukkan kemiripan tinggi dengan urutan genom kloroplas R. gigantea dengan nomor akses EF670411.1 yang tersedia di database NCBI. Penyelarasan urutan IGS trnL(UAA)-trnF(GAA) di antara enam sampel R. gigantea memang menunjukkan beberapa perbedaan genetik, tetapi urutan ini tidak dapat digunakan untuk membedakan ekspresi gen warna bunga antara kedua kultivar R. gigantea. Urutan trnL-trnF pada enam bahan R. gigantea yang diperiksa dalam penelitian ini juga memiliki komposisi basa yang hampir serupa, menunjukkan adanya perbedaan genetik yang rendah di antara sampel. |
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Rhynchostylis gigantea (Lindl.) Ridl. is an orchid species that exhibits variation in flower patterns and colours, specifically peach and white. Therefore, as an ornamental plant species of high economic value, this is now listed in Appendix II of CITES, mainly due to overexploitation and complicated reproduction system. Therefore, genetic conservation efforts are necessary, which should be preceded by studies on the genetic diversity. This study aims to determine the sequences of the trnL (UAA) – trnF (GAA) IGS molecular marker in two different cultivars of R. gigantea and to identify the existence of genetic difference between both cultivars based on the molecular marker. The results indicate that the IGS trnL(UAA)-trnF(GAA) sequences of approximately 500 bp before editing and 481 bp after editing were observed. All six sequences show high similarity to the chloroplast genome sequence of R. gigantea with accession number EF670411.1 available in the NCBI database. Alignment on the IGS trnL(UAA)-trnF(GAA) sequences among the six R. gigantea samples does exhibit some genetic difference, but these sequences could not be used to distinguish flower colour gene expression between the two R. gigantea cultivars. The trnL-trnF sequences in the six materials of R. gigantea examined in this study also had a nearly similar base composition, suggesting the existence of low genetic differences among samples. |
|---|
| Kata kunci | genetic diversity, Rhynchostylis gigantea, trnL (UAA) – trnF (GAA) IGS |
|---|
| Pembimbing 1 | Prof. Dr. Agus Hery Susanti, M.S. |
|---|
| Pembimbing 2 | Prof. Dr. Murni Dwiati, M.Si. |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2025 |
|---|
| Jumlah Halaman | 10 |
|---|
| Tgl. Entri | 2025-02-05 14:29:00.446337 |
|---|