| NIM | B1J008127 |
|---|
| Namamhs | YENI PARERA |
|---|
| Judul Artikel | KERAGAMAN STRAIN Rhizopus oligosporus DARI BEBERAPA INOKULUM TEMPE BERDASARKAN MARKA RAPD |
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Inokulum tempe terdiri atas mikrofungi, salah satunya Rhizopus oligosporus. Karakteristik masing-masing strain berkaitan dengan keragaman genetik dapat diketahui melalui pendekatan molekuler, salah satunya dengan teknik RAPD. RAPD merupakan marka (penanda) DNA yang dapat digunakan dalam mempelajari keragaman organisme melalui polimorfisme DNA dalam satu populasi. Penggunaan RAPD telah terbukti efektif untuk mengungkap variasi genetik pada berbagai mikrofungi. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis pola pita DNA yang terbentuk serta tingkat keragaman strain R. oligosporus, menggunakan metode survey dan dianalisis dengan program GenAlex (Genetic Analysis in Excel) 6.1 dan NTSYS (Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System) 2.02i. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pola pita DNA enam strain R. oligosporus dari berbagai inokulum tempe sangat berbeda, baik jumlah maupun ukurannya. Tingkat keragaman yang diperoleh juga cukup tinggi, isolat RRP2B memiliki kekerabatan paling dekat dengan isolat RRP1A (96%), sementara kekerabatan yang paling jauh yaitu isolat RRP2A dan isolat RRP1B dengan indeks similaritas sebesar 0%. Penelitian ini memberikan informasi ilmiah tentang keragaman strain R. oligosporus pada inokulum tempe berbeda, yang dapat dijadikan data dasar untuk menentukan kombinasi strain secara tepat, sehingga didapat inokulum tempe berkualitas baik. |
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Inoculum of tempeh consists of microfungi, i. e., Rhizopus oligosporus. Characteristic of strain related to genetic diversity can be detected through molecular approaches, one of which is RAPD technique. RAPD is a DNA marker that can be used to study the diversity of organisms through DNA polymorphisms within a population (species). The use of RAPD has been proven to be effective to reveal genetic variation at various microfungi. This research aimed to analyze the DNA banding patterns and the diversity of R. oligosporus strain, using survey method and to analyzed with GenAlex (Genetic Analysis in Excel) 6.1 and NTSYS (Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System) 2.02i programs. The results showed that the DNA banding patterns of six strains of R. oligosporus inoculum of various tempeh were very different, both in number and size. Diversity level was also quite high. RRP2B isolate had the closest kinship with RRP1A isolate (96%), while the most distant kinship was RRP2A and RRP1B isolates with similarity index of 0%. This research provided scientific information on the diversity of R. oligosporus strain in different tempeh inoculums. Which could be used as baseline data to determine the exact strain combination, in order to get good quality of tempeh inoculum. |
|---|
| Kata kunci | keragaman, polimorfisme, RAPD, Rhizopus oligosporus, strain |
|---|
| Pembimbing 1 | Dr. Nuniek Ina Ratnaningtyas, M.S. |
|---|
| Pembimbing 2 | Saefudin Aziz, S.Si., M.Si |
|---|
| Pembimbing 3 | - |
|---|
| Tahun | 2013 |
|---|
| Jumlah Halaman | 31 |
|---|
| Tgl. Entri | (belum diset) |
|---|