Artikel Ilmiah : I1C019049 a.n. R. FAIHA SALSABILA
| NIM | I1C019049 |
|---|---|
| Namamhs | R. FAIHA SALSABILA |
| Judul Artikel | Analisis Molecular Networking dan Aktivitas Antibakteri Ekstrak Bakteri Sinomicrobium sp. PAP.21 yang Dikultur dengan Metode OSMAC |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Latar belakang: Antimicrobial resistance (AMR) termasuk salah satu masalah kesehatan global yang dapat diatasi dengan meningkatkan penelitian eksplorasi senyawa antibakteri dari laut. Salah satunya adalah bakteri Sinomicrobium sp. PAP.21. yang diisolasi dari sedimen Taman Nasional Teluk Cendrawasih, Papua Barat yang belum banyak dikaji potensinya. Pendekatan OSMAC meningkatkan peluang dihasilkan senyawa baru dengan mengaktifkan silent biosynthetic gene clusters (BGCs). Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis molecular networking dan menguji aktivitas antibakteri ekstrak Sinomicrobium sp. PAP.21 yang dikultur dengan metode OSMAC. Metodologi: Bakteri Sinomicrobium sp. PAP.21 ditumbuhkan dalam lima komposisi media padat berbeda (media Luria Bertani agar, A1BFe+C agar, Nutrient Agar, RL1 agar dan Air laut + agar) dengan waktu inkubasi 7 hari dan diekstraksi menggunakan dua pelarut berbeda (etil asetat dan metanol). Sebanyak 30 ekstrak bakteri Sinomicrobium sp. PAP.21 terdiri dari 15 ekstrak EtOAc dan 15 ekstrak MeOH diukur menggunakan LC-HRMS, lalu dianalisis dengan GNPS. Semua ekstrak diuji aktivitas antibakteri secara in vitro terhadap Micrococcus luteus dan Escherichia coli. Hasil: Hasil analisis molecular networking didapatkan 2 senyawa aktif yaitu surfactin C14 dan sarmentoside B yang berpotensi sebagai antibakteri. Surfactin C14 diproduksi oleh bakteri yang dikultur pada media RL1 dan diekstraksi dengan EtOAc. Ekstrak EtOAc dan MeOH bakteri Sinomicrobium sp. PAP.21 pada media LB dan A1BFe+C menunjukkan aktivitas antibakteri terhadap M. luteus. Sama halnya pada ekstrak EtOAc dari media NB juga dapat menghambat pertumbuhan M. luteus. Namun, tidak ada satupun ekstrak yang menunjukkan aktivitas antibakteri terhadap E. coli. Kesimpulan: Analisis molecular networking menunjukkan adanya 2 senyawa aktif dengan potensi antibakteri. Sedangkan, hasil uji in vitro didapatkan 5 ekstrak bakteri Sinomicrobium sp. PAP.21 yang dikultur pada 3 media padat dengan aktivitas antibakteri yang lemah. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Background: Antimicrobial resistance (AMR) is one of the global health problems that can be addressed by exploring antibacterial compounds from the sea. One of them is Sinomicrobium sp. PAP.21 bacteria, which was isolated from the sediment of Teluk Cendrawasih National Park, West Papua, and has not been extensively studied for its potential. The OSMAC approach enhances the chance of discovering new compounds through activating silent biosynthetic gene clusters (BGCs). This study aims to analyze molecular networking and antibacterial activity test of Sinomicrobium sp. PAP.21 extracts were cultured using the OSMAC method. Method: The bacterium Sinomicrobium sp. PAP.21 was cultured in five different solid media compositions (Luria Bertani, A1BFe+C, Nutrient, RL1 and Seawater) with a 7-day incubation period and extracted using two different solvents (ethyl acetate and methanol). A total of 30 extracts from Sinomicrobium sp. PAP.21 were obtained, consisting of 15 EtOAc extract and 15 MeOH extract, which were measured using LC-HRMS, then analyzed with GNPS. All extracts were tested for in vitro antibacterial activity against Micrococcus luteus and Escherichia coli. Result: Molecular networking analysis revealed two active compounds, surfactin C14 and sarmentoside B, which have potential as antibacterial properties. Surfactin C14 was produced from bacteria cultured in RL1 media and extracted with EtOAC. EtOAc and MeOH extracts of Sinomicrobium sp. PAP.21 in LB and A1BFe+C media showed antibacterial activity against M. luteus. Similarly, EtOAc extracts from NB media were also able to inhibit the growth of M. luteus. However, none of the extracts showed antibacterial activity against E. coli. Conclusion: Molecular networking analysis revealed two active compounds with antibacterial potential. While the in vitro test result showed 5 extracts from Sinomicrobium sp. PAP.21 cultured on 3 solid media with weak antimicrobial activity. |
| Kata kunci | antimicrobial resistance (AMR), antibakteri, molecular networking, OSMAC, Sinomicrobium sp. |
| Pembimbing 1 | Dr.rer.nat. apt. Harwoko, M.Sc |
| Pembimbing 2 | Dr.rer.nat. Riyanti, ST. M.Biotech |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2023 |
| Jumlah Halaman | 11 |
| Tgl. Entri | 2023-12-14 09:12:30.719707 |