| NIM | I1C019083 |
|---|
| Namamhs | ANGGUN TRI RAHMAWATI |
|---|
| Judul Artikel | ANALISIS METABOLIT SEKUNDER EKSTRAK ETIL ASETAT BAKTERI Sinomicrobium sp. PAP.21 DARI TEKNIK OSMAC DAN SKRINING AKTIVITAS ANTIBAKTERINYA |
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Tantangan dalam penemuan obat baru diantaranya klaster gen biosintesis yang diam pada kondisi laboratorium standar. Di sisi lain, penemuan kembali senyawa yang telah diketahui sebelumnya sulit dihindari. Namun demikian, pendekatan OSMAC dan analisis molecular networking dapat diterapkan untuk memperoleh senyawa bioaktif baru. Preculture bakteri Sinomicrobium sp. PAP.21 dari sedimen yang dikoleksi di Teluk Cenderawasih Papua Barat ditambahkan dalam kultur, lalu strain ditumbuhkan dalam lima media cair yang berbeda (RL1, A1BFe+C, NB, LB dan air laut) selama 4, 5, dan 7 hari. Kultur diekstraksi menggunakan etil asetat secara terpisah untuk tiap media dan waktu inkubasi, kemudian diukur dengan LC-HRMS. Sebanyak 45 ekstrak etil asetat diuji aktivitas antibakteri secara in vitro terhadap Micrococcus luteus, Escherichia coli dan MRSA. Hasil analisis molecular networking dengan GNPS menunjukkan 13 senyawa berpotensi sebagai antibakteri, tiga diantaranya berasal dari satu media dalam satu waktu inkubasi. Aktivitas antibakteri terhadap M. luteus ditunjukkan pada ekstrak dari media A1BFe+C, LB dan air laut, meskipun tidak ada ekstrak yang dapat menghambat E. coli. Ekstrak dari media LB pada hari ke-7 mampu menghambat pertumbuhan MRSA dengan daya hambat sebesar 88%. Bakteri Sinomicrobium sp. PAP.21 mampu memproduksi senyawa aktif yang berpotensi sebagai antibakteri terhadap M. luteus dan MRSA. |
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Challenges in drug discovery including biosynthetic gene clusters which remain silent under standard laboratory culture condition. On the other hand, rediscovery of the known compounds is inevitable. However, OSMAC approach and molecular networking analysis are currently applicable to find new bioactive compounds. Preculture of Sinomicrobium sp. PAP.21 isolated from sediment collected at Cenderawasih Bay West Papua, was added in culture, then the strain was grown in five different liquid media (RL1, A1BFe+C, NB, LB, and seawater media) and incubated for 4, 5, and 7 days. The bacterial cultures were extracted using ethyl acetate separately for each media and incubation period, followed by LC-HRMS measurement. A total of 45 ethyl acetate extracts were assayed for in vitro antibacterial activity against Micrococcus luteus, Escherichia coli, and MRSA. Molecular networking analysis through GNPS indicated that 13 compounds possessed antibacterial potential, three of them produced from a single media and one incubation period. Antibacterial activity was demonstrated by extracts from A1BFe+C, LB and seawater media against M. luteus. Although none showed antibacterial activity towards E. coli. Extracts from LB media on the 7th day incubation were able to inhibit the growth of MRSA by 88%. Sinomicrobium sp. PAP.21 was able to produce bioactive compounds possessing antibacterial potential, particularly against M. luteus and MRSA. |
|---|
| Kata kunci | antibakteri, LC-HRMS, molecular networking, OSMAC, Sinomicrobium sp. PAP.21 |
|---|
| Pembimbing 1 | Dr.rer.nat. apt. Harwoko, M.Sc |
|---|
| Pembimbing 2 | Dr.rer.nat. Riyanti, ST., M.Biotech |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2023 |
|---|
| Jumlah Halaman | 15 |
|---|
| Tgl. Entri | 2023-08-01 15:02:34.755731 |
|---|