Artikel Ilmiah : B1B019009 a.n. DHANY HILMY MAHENDRA
| NIM | B1B019009 |
|---|---|
| Namamhs | DHANY HILMY MAHENDRA |
| Judul Artikel | Morphological and molecular Tracing of Two Ornamental Vampire Crabs from Central Java |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Geosesarma dennerle dan G. hagen memiliki karakteristik yang mirip berdasarkan karapas persegi, gigi orbit luar yang besar, segitiga, melengkung ke luar, ujung melampaui karapas lateral dan spesies air tawar sepenuhnya, tetapi mereka dapat dibedakan dengan variasi warna pada karapas. Hasil penelitian menunjukkan bahwa nilai Asymp. sig pada tabel uji Mann-Whitney U adalah 0,988. Berdasarkan hipotesis (0,988 > 0,05), hasil tersebut menggambarkan bahwa tidak terdapat perbedaan morfometrik yang signifikan antara Geosesarma dennerle dan G. hagen. Referensi gen COI G. dennerle dan G. hagen tidak tersedia di GenBank dan juga gen 16s RNA dari G. dennerle. Namun, urutan RNA 16s untuk G. hagen dari tangkapan alam, seperti BIC-0552, BIC-0553, BIC-0554, BIC-0555, dan BIC-0556, memiliki identitas berpasangan masing-masing sekitar 99,6%, 99,6%, 99,4%, 99,6%, dan 99,6%. Sementara itu, sampel perdagangan G. hagen, BIC-0565, memiliki identitas berpasangan sebesar 99,6% dibandingkan dengan G. hagen pada GenBank untuk gen RNA 16s [Tsang et al., 2022]. Pohon filogenetik menunjukkan dua perbedaan klade antara Geosesarma hagen dan G. dennerle, dengan nilai bootstrap pendukung di atas 70. Ambang batas jarak genetik antara Geosesarma dennerle dan G. hagen adalah 1,8%, sedangkan Geosesarma sp.1 (BIC-0562) memiliki kisaran yang relatif lebih besar sekitar 17,4-18,5% dibandingkan dengan G. hagen dan sekitar 17,6-19,8% dibandingkan dengan G. denner le, sedangkan Geosesarma sp.2 (BIC-0566) memiliki rentang jarak genetik yang lebih rendah masing-masing sekitar 2,8-3,4% dan 2,5-18,1% untuk Geosesarma hagen dan G. dennerle. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Geosesarma dennerle and G. hagen have similar characteristics based on square carapace, large outer orbit teeth, triangular, outwardly curved, tip extends beyond lateral carapace and completely freshwater species, but they can be distinguished by color variations on the carapace. The results show that the value of Asymp. sig in the Mann-Whitney U test table is 0.988. Based on the hypothesis (0.988 > 0.05), the results illustrate that there are no significant morphometric differences between Geosesarma dennerle and G. hagen. The references of COI gene of G. dennerle and G. hagen were not available on GenBank and 16s RNA gene of G. dennerle as well. However, the 16s RNA sequences for G. hagen from natural catch, such as BIC-0552, BIC-0553, BIC-0554, BIC-0555, and BIC-0556, have pairwise identities about 99.6%, 99.6%, 99.4%, 99.6%, and 99.6%, respectively. Meanwhile, trade sample G. hagen, BIC-0565, has a pairwise identity of 99.6% compared to G. hagen on GenBank for 16s RNA gene [Tsang et al., 2022]. The phylogenetic trees show a two differences clade between Geosesarma hagen and G. dennerle, with supporting bootstrap value aboves 70. The genetic distance threshold between Geosesarma dennerle and G. hagen is at 1.8%, while Geosesarma sp.1 (BIC-0562) has a relatively larger range approximately 17.4-18.5% compared to G. hagen and around 17.6-19.8% compared to G. dennerle, whereas Geosesarma sp.2 (BIC-0566) has lower ranges of genetic distance about 2.8-3.4% and 2.5-18.1% for Geosesarma hagen and G. dennerle, respectively. |
| Kata kunci | bootstrap, cytochrome oxidase subunit I (COI), DNA, Genetic distance, Geosesarma, molecular, thresholds. |
| Pembimbing 1 | Prof. Dr. Agus Nuryanto, S.Si., M.Si |
| Pembimbing 2 | Rena Tri Hernawati, S.Si., M.Si |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2023 |
| Jumlah Halaman | 8 |
| Tgl. Entri | 2023-07-25 21:09:35.118266 |