Artikel Ilmiah : I1C019005 a.n. PUTRI HEQIYANA
| NIM | I1C019005 |
|---|---|
| Namamhs | PUTRI HEQIYANA |
| Judul Artikel | Prediksi Mekanisme Aksi Resveratrol sebagai Antikanker Prostat Menggunakan Pendekatan Bioinformatika |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Kanker prostat merupakan kanker ke-2 yang paling sering didiagnosis pada pria. Kanker prostat merupakan penyebab kedua kematian diseluruh dunia, namun pada pengobatannya masih terdapat resistensi sehingga diperlukan eksplorasi senyawa dari bahan alam, salah satunya yaitu resveratrol yang memiliki aktivitas sitotoksik terhadap sel kanker prostat. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui protein target potensial dan profil molecular docking senyawa resveratrol terhadap kanker prostat. Analisis bioinformatika menggunakan STITCH, STRING untuk mencari target protein resveratrol. Target potensial resveratrol dianalisis menggunakan Venny 2.1. WebGestalt digunakan untuk mendapatkan informasi terkait gen ontologi, jalur KEGG, dan asosiasi obat serta diolah menggunakan Cytoscape untuk mendapatkan top 10 hub gene. Analisis molecular docking menggunakan ChemDraw, AutoDock Tools, PyMol, AutoDock Vina untuk mendapatkan energi ikatan dan divisualisasikan menggunakan DS Biovia. Hasil analisis bioinformatika didapatkan top 10 hub gene yaitu TP53, AKT1, CTNNB1, ESR1, EP300, SIRT1, PPARG, STAT3, HIF1A, JUN. Analisis molecular docking senyawa resveratrol terhadap AKT1 dan CTNNB1 menghasilkan energi ikatan yang lebih besar daripada kontrol positif. Selain itu, resveratrol juga mengikat residu asam amino pada sisi aktif masing- masing protein. Target protein resveratrol terhadap kanker prostat yaitu pada protein AKT1 memiliki nilai energi ikatan yang lebih besar dibandingkan dengan kontrol positifnya yaitu capivasertib dan pada protein CTNNB1 memiliki nilai energi ikatan yang sama dengan kontrol positifnya yaitu ICRT3. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Prostate cancer is the 2nd most frequently diagnosed cancer in men. Prostate cancer is the second leading cause of death worldwide, but there is still resistance to its treatment so exploration of compounds from natural ingredients is needed, one of which is resveratrol which has cytotoxic activity against prostate cancer cells. This study aims to determine the potential target protein and molecular docking profile of resveratrol compounds against prostate cancer. Bioinformatic analysis using STITCH, STRING to search for resveratrol protein targets. Resveratrol potential target were analyzed using Venny 2.1. WebGestalt was used to obtain information related to gene ontology, KEGG pathways, and drug associations and was processed using Cytoscape to obtain the top 10 hub genes. Molecular docking analysis using ChemDraw, AutoDock Tools, PyMol, AutoDock Vina to obtain bond energy and visualized using DS Biovia. The results of bioinformatics analysis showed that the top 10 hub genes were TP53, AKT1, CTNNB1, ESR1, EP300, SIRT1, PPARG, STAT3, HIF1A, JUN. Molecular docking analysis of resveratrol compounds against AKT1 and CTNNB1 resulted in a bond energy that was greater than the positive control. In addition, resveratrol also binds to amino acid residues on its side active for each protein. Target of resveratrol protein for prostate cancer is the AKT1 protein which has a higher bond energy value than the positive control namely capivasertib and the CTNNB1 proteins which has the same bond energy value as the positive control namely ICRT3. |
| Kata kunci | Kata Kunci : Resveratrol, Bioinformatika, Molecular Docking, Antikanker prostat |
| Pembimbing 1 | Dr. M. Salman Fareza, M.Si |
| Pembimbing 2 | Dr. apt. Sarmoko, M.Sc |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2023 |
| Jumlah Halaman | 10 |
| Tgl. Entri | 2023-07-20 11:12:17.394882 |