Artikel Ilmiah : B1B017035 a.n. MUSTAQIM
| NIM | B1B017035 |
|---|---|
| Namamhs | MUSTAQIM |
| Judul Artikel | Genetic Profiles of Abelmsochus Members Using RAPD Markers |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Abelmoschus (Malvaceae) merupakan satu genus tumbuhan yang terdiri dari banyak spesies tumbuhan. Tiga spesies yang ditemukan di Indonesia yaitu A. esculentus, A. manihot dan A. moschatus. Anggota genus ini telah dibudidayakan di banyak negara karena kandungan nutrisinya yang tinggi seperti vitamin C, asam linoleat, protein dan mineral seperti kalsium, kalium, fosfor dan tembaga. Akhir-akhir ini, minat terhadap manfaat ekonomi dari tanaman ini semakin meningkat, namun sayangnya penelitian tentang keragaman genetik masih sangat terbatas. Penelitian ini menganalisis penanda molekuler tiga spesies Abelmoschus menggunakan penanda PCR-RAPD. Total 8 primer yang digunakan antara lain OPA-02, OPA-09, OPAE-03, OPAE-15, OPAN-01, OPX-17, OPX-18, dan UBC-210. Data molekuler dianalisis dengan software Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) 6.06 dengan UPGMA (Unweighted Pair-Group Method Arithmetic) untuk mendapatkan dendogram yang menunjukkan hubungan genetik antar sampel. Hasil penanda PCR-RAPD menunjukkan profil RAPD tiga spesies Abelmoschus dan Hibiscus rosa-sinensis sebagai outgroup menghasilkan total 24 pita dengan 1 pita monomorfik dan 23 pita polimorfik. Jumlah pita tertinggi diperoleh dari primer OPX-17 yang menghasilkan 7 pita dengan tingkatpolimorfisme 100%. Jumlah pita paling sedikit adalah 1 pita berpola monomorfik yang diperoleh primer OPA-02, sedangkan primer UBC-210 dengan pita tunggal bersifat polimorfik. Hubungan genetik antara tiga spesies Abelmoschus menunjukkan bahwa A. esculentus dan A. manihot mempunyai jarak genetik terdekat di antara yang lain. UPGMA menunjukkan dendogram yang mengelompokkannya menjadi 2 kelompok. Kelompok I terdiri dari A. esculentus dan A. manihot sedangkan Kelompok II terdiri dari A. moschatus. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Abelmoschus (Malvaceae), a plant genus, comprises of many plant species. Three species of them are found in Indonesia, namely A. esculentus, A. manihot and A. moschatus. The members of this genus have been being cultivated in many countries for their nutrition content like vitamin C, linoleic acid, protein and minerals such as calcium, potassium, phosphorus and chopper. Recently, there has been increase interest in about the economic benefits of these plants, but, unfortunately the researches on genetic diversity were very limited. This study analyzed the molecular marker of three Abelmoschus species using PCR-RAPD marker. Total 8 primers were used including OPA-02, OPA-09, OPAE-03, OPAE-15, OPAN-01, OPX-17, OPX-18, and UBC-210. The molecular data was analyzed by Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) 6.06 software with UPGMA (Unweighted Pair-Group Method Arithmetic) to obtain the dendogram, which shows the genetic relationships among the samples. The result of PCR-RAPD marker shows RAPD profiles of three Abelmoschus species and Hibiscus rosa-sinensis as an outgroup produced a total 24 bands with 1 monomorphic bands and 23 polymorphic bands. The highest number of bands was obtained from OPX-17 primer which produced 7 bands with 100% polymorphism. The lowest number of bands was 1 band in monomorphic pattern obtained by OPA-02 primer, but the UBC-210 primer with single band was in polymorphic. The genetic relationships between three Abelmoschus species shows that A. esculentus and A. manihot are closest genetic distances among others. UPGMA shows dendogram that grouping them into 2 groups. The Group I consist of A. esculentus and A. manihot while the Group II consist of A. moschatus. |
| Kata kunci | Abelmsoschus, genetic diversity, RAPD |
| Pembimbing 1 | Dr.sc.Agr. Nurtjahjo Dwi Sasongko, M.App.Sc. |
| Pembimbing 2 | Dr. Pudji Widodo, M.Sc. |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2022 |
| Jumlah Halaman | 10 |
| Tgl. Entri | 2022-08-16 08:47:30.29455 |