Artikel Ilmiah : A1D017063 a.n. ALWA WIDI AISYA
| NIM | A1D017063 |
|---|---|
| Namamhs | ALWA WIDI AISYA |
| Judul Artikel | Identifikasi Marka Molekuler Sifat Toleran Salin pada Tanaman Padi |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan marka SSR dan STS yang dapat membedakan varietas padi toleran salin dengan yang tidak toleran salin dan mengetahui nilai Polymophic Information Content (PIC) dari setiap marka yang digunakan. Penelitian telah dilaksanakan pada bulan September 2020 hingga Februari 2021 di Laboratorium Pemuliaan Tanaman dan Bioteknologi Fakultas Pertanian serta Laboratorium Riset Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto, Jawa Tengah. Marka molekuler yang diidentifikasi terdiri dari 9 marka SSR (RM 212, RM 222, RM 223, RM 224, RM 225, RM 3412, RM 342, RM 444, RM 478, RM 8094, RM 8264) dan 1 marka STS (Wn 11463). Varietas padi yang digunakan adalah Nona Bokra, Inpari Unsoed 79 Agritan, Cisadane, Atomita 2, Pelopor, Dendang, Lambur, Siak Raya, Unsoed Parimas, Inpago Unsoed 1, dan IR 29. Kontrol yang digunakan dalam proses skoring adalah varietas Nona Bokra yang merupakan varietas toleran salin. Data skoring dianalisis secara Principal Component Analysis Biplots(PCA Biplot) menggunakan XLSTAT 2020. Hasil Penelitian menunjukan bahwa marka RM 225, RM 3412, RM 342, RM 8094, dan Wn 11463 dapat membedakan varietas toleran salin. Nilai PIC dari marka RM 223, RM 3412, RM 342 adalah 0,56, 0,68, dan 0,53 yang tergolong sangat informatif, nilai PIC dari marka RM 212, RM 222, RM 223, RM 224, RM 225, RM 8264, Wn 11463 adalah 0,47, 0,36, 0,56, 0,32, 0,48, 0,36 dan 0,32 yang tergolong marka kelas sedang, serta RM 8094 dengan nilai PIC 0,15 tergolong dalam kelas rendah. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | The objectives of this research is to obtain markers that can differentiate salt tolerance varieties and to find out Polymophic Information Content I (PIC) value of the markers used. The research was conducted in September 2020 – February 2021 at Plant Breeding and Biotechnology Laboratory Faculty of Agriculture and Research Laboratory Jenderal Soedirman University. The identified molecular marker consisted of 9 SSR marker (RM 212, RM 222, RM 223, RM 224, RM 225, RM 3412, RM 342, RM 444, RM 478, RM 8094, RM 8264) and 1 STS marker (Wn 11463). The rice varieties that used in this research were Nona Bokra, Inpari Unsoed 79 Agritan, Cisadane, Atomita 2, Pelopor, Dendang, Lambur, Siak Raya, Unsoed Parimas, Inpago Unsoed 1, and IR 29. Nona Bokra is a salt tolerant variety were used as control in scoring. The scoring result are binary data which are then processed by Principal Component Analysis Biplot (PCA Biplot) using XLSTAT 2020. The result of this research show that marker RM 225, RM 3412, RM 342, RM 8094, dan Wn 11463 can differentiate salt tolerance varieties. The PIC values of RM 223, RM 3412, RM 342 markers are 0.56, 0.68, and 0.53 which are classified as very informative markers, the PIC values of RM 212, RM 222, RM 223, RM 224, RM 225, RM 8264, Wn 11463 markers are 0.47, 0.36, 0.48, 0.36, and 0.32 which are classified as middle class markers, and the PIC value of RM 8094 marker is 0.15 which is classified as low class. |
| Kata kunci | SSR (Simple Sequence Repeat), STS (Single Tagged Sequence), gen toleran salin, PCA (Principal Component Analysis), Oryza sativa. |
| Pembimbing 1 | Ir. Suprayogi, M. Sc., Ph.D |
| Pembimbing 2 | Prita Sari Dewi, S.P., M. Sc., Ph.D |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2021 |
| Jumlah Halaman | 12 |
| Tgl. Entri | 2021-07-05 17:56:42.276695 |