Artikel Ilmiah : L1A015034 a.n. ANNISSA AMBARYATI MAHANI
| NIM | L1A015034 |
|---|---|
| Namamhs | ANNISSA AMBARYATI MAHANI |
| Judul Artikel | KERAGAMAN GENETIK RUMPUT LAUT Gracilaria verrucosa DARI PANTAI SELATAN JAWA MENGGUNAKAN METODE RAPD |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Rumput laut Gracilaria verrucosa memiliki morfologi yang beragam. Perbedaan karakter morfologi dapat menyebabkan kesalahan dalam pengidentifikasian. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetik dan hubungan kekerabatan antar spesies rumput laut Gracilaria verrucosa dari Pantai Karangnini, Nusakambangan dan Menganti. Metode yang digunakan untuk isolasi DNA adalah metode CTAB dan diamplifikasi dengan PCR-RAPD. Primer yang digunakan adalah primer acak OPA-02 (5’ TGCGGAGCTG -3’). Analisis data morfologi menggunakan program Winclad dan data molekuler menggunakan program PyElph. Hasil pengukuran konsentrasi DNA rumput laut Gracilaria verrucosa berkisar antara 243-478,5 µg/ml. Visualisasi DNA menunjukan 7 pita polimorfik dengan presentasi polimorfik sebesar 100%. Nilai jarak matrik antara 3 spesies rumput laut Gracilaria verrucosa dari Pantai Karangnini, Nusakambangan, dan Menganti berkisar antara 0,0-50,0. Fenogram yang dihasilkan baik secara morfologi dan molekuler menunjukan dua kluster utama. Jarak genetik terdekat sebesar 30,0 ditemukan pada rumput laut Gracilaria verrucosa dari Pantai Karangnini dan Nusakambangan. Jarak genetik terjauh sebesar 50,0 ditemukan pada rumput laut Gracilaria verrucosa dari Pantai Menganti. Kata Kunci : Gracilaria verrucosa; Keragaman Genetik; RAPD. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Gracilaria verrucosa seaweed has a diverse morphology. The differences in morphological characters can cause mistakes in identification. This study aims to determine genetic diversity and kinship relationships between species of Gracilaria verrucosa seaweed from Karangnini, Nusakambangan and Menganti Beach. The method used for DNA isolation was the CTAB method and amplified by PCR-RAPD. The primer used was OPA-02 random primer (5 'TGCGGAGCTG -3'). Morphological data were analysed using the Winclad program and molecular data were analysed using the PyElph program. The results measurements of DNA concentration of Gracilaria verrucosa seaweed ranged from 243-478.5 µg/ml. DNA visualization showed 7 polymorphic bands with 100% polymorphic presentation. The distance between the 3 species of Gracilaria verrucosa seaweed from the Karangnini Beach, Nusakambangan, and Menganti ranged between 0.0-50.0. Phenograms produced both morphologically and molecularly showed two main clusters. The closest genetic distance of 30,0 was found in Gracilaria verrucosa seaweed from Karangnini and Nusakambangan Beach. The furthest genetic distance of 50,0 was found in Gracilaria verrucosa seaweed from Menganti Beach. Keywords: Gracilaria verrucosa; Genetic Diversity; RAPD. |
| Kata kunci | Gracilaria verrucosa; Keragaman Genetik; RAPD. |
| Pembimbing 1 | Dr. Maria Dyah Nur Meinita, S.Pi., M.Sc. |
| Pembimbing 2 | Dr. rer. nat Hamdan Syakuri, S.Pi., M.Si. |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2020 |
| Jumlah Halaman | 10 |
| Tgl. Entri | 2020-02-19 10:54:33.03914 |