| NIM | B1A015091 |
|---|
| Namamhs | FAJAR NUR SULISTYAHADI |
|---|
| Judul Artikel | Analisis Keragaman Rhacophorus margaritifer (Schlegel, 1837) di Kecamatan Baturraden Berdasarkan Marka RAPD
|
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Katak Pohon Jawa, Rhacophorus margaritifer merupakan spesies katak endemik Pulau Jawa yang memiliki habitat arboreal. Beberapa penelitian sebelumnya berhasil menemukan katak ini di beberapa lokasi di Kecamatan Baturaden, yaitu hutan alami kawasan Ketengger, jalur wisata Pancuran Pitu dan Kebun Raya Baturaden. Data keragaman katak R. margaritifer di area Gungung Slamet masih terlalu sedikit, terutama dalam bidang molekuler. Sementara itu, informasi mengenai keragaman molekuler suatu spesies sangat penting dalam mengelola strategi konservasi. Langkah awal yang dapat dilakukan untuk menyediakan data keragaman genetik tersebut adalah karakterisasi molekuler berdasarkan marka RAPD. Dengan menggunakan teknik PCR-RAPD, penelitian ini betujuan untuk melihat polimorfisme genetik dan mengetahui keragaman lokus populasi R. margaritifer di Kecamatan Baturaden. Pengambilan sampel katak dilakukan menggunakan Teknik purposive sampling pada tiga populasi katak R. margaritifer di hutan alami kawasan Ketengger, jalur wisata Pancuran Pitu dan Kebun Raya Baturaden. Ekstraksi DNA menggunakan metode Chelex dan dilakukan karakterisasi molekuler berdasarkan marka RAPD. Data polimorfisme DNA marka RAPD diubah menjadi data 0˗1 dan dianalisis menggunakan software Arlequin ver. 3.5. Sebanyak 19 sampel yang didapatkan dari hasil sampling di tiga lokasi memperlihatkan corak dorsal tubuh yang bervariasi. Analisis deskriptif warna ventral tungkai menunjukkan adanya perbedaan pada populasi HPK 02. Masing-masing populasi memiliki keragaman gen sangat tinggi yaitu 1,0000 KRB; 0.9643 HPK 01; 1,0000 HPK 02 sedangkan keragaman lokus yaitu 0.159524 KRB; 0.165816 HPK 01; 0.192857 HPK 02. AMOVA pada perangkat lunak Arlequin ver. 3.5 menghasilkan P-value dengan angka 0.50244. Berdasarkan hasil tersebut ditarik kesimpulan bahwa secara molekuler tidak ada perbedaan di antara tiga populasi. Ketiga populasi R. margaritifer di Kecamatan Baturaden memiliki individu-individu yang beragam. |
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Java Flying Frog, Rhacophorus margaritifer is an endemic species in Java Island that has arboreal habitat. Several prior studies had found this frog in three locations in Baturaden Subdistrict, namely the primary forest of the Ketenger, the Pancuran Pitu tourist track and the Kebun Raya Baturaden. Diversity data of R. margaritifer in the Mount Slamet area is still too little, especially in the molecular field. Meanwhile, information about the molecular diversity of a species is crucial in managing conservation strategies. The first step to provide genetic diversity data can be done by molecular characterization based on RAPD markers. By using the PCR-RAPD technique, this study aims to look at genetic polymorphisms and determine the locus diversity R. margaritifer population in Baturaden Subdistrict. Frog sampling was carried out using purposive sampling technique in three populations of R. margaritifer in the primary forest of the Ketenger, the Pancuran Pitu tourist track and the Kebun Raya Baturaden. DNA extracted from frog tissue by using the Chelex methods. Molecular characterization based on RAPD markers. The DNA polymorphism data of the RAPD marker was changed to data 0˗1 and analyzed using Arlequin ver. 3.5. Total of 19 samples obtained from sampling at three locations showed varying dorsal patterns. Descriptive analysis of ventral limb color showed a difference in the HPK 02 population. Each population had a very high gene diversity, 1,0000 of KRB; 0.9643 of HPK 01; 1,0000 of HPK 02 while the locus diversity is 0.159524 of KRB; 0.165816 of HPK 01; 0.192857 of HPK 02. AMOVA on produces P-value of 0.50244. Based on these results, it was concluded that there was no molecular difference among the three populations. Each three populations of R. margaritifer in Baturaden Subdistrict have polymorphic individuals. |
|---|
| Kata kunci | Baturaden, keragaman genetik, RAPD, Rhacophorus margaritifer |
|---|
| Pembimbing 1 | Dr. Agus Nuryanto, S.Si., M.Si. |
|---|
| Pembimbing 2 | I Gusti Agung Ayu Ratna Puspitasari, S.Si., M.Sc. |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2019 |
|---|
| Jumlah Halaman | 7 |
|---|
| Tgl. Entri | 2019-08-28 19:00:12.534689 |
|---|