| NIM | L1B015050 |
|---|
| Namamhs | MIFTA ARFADINA FITRI |
|---|
| Judul Artikel | ISOLASI DAN ANALISIS SEKUENS GEN PENYANDI GROWTH HORMONE RECEPTOR I (GHR-1) PADA SIDAT (Anguilla bicolor) |
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Sidat (Anguilla bicolor) adalah komoditas perikanan Indonesia yang memiliki potensi ekspor yang besar, namun terhalang dengan pertumbuhan sidat yang lambat. Pertumbuhan sidat dipengaruhi oleh Growth Hormone Receptor I (GHR-I) yang berfungsi untuk menangkap sinyal Growth Hormone (GH) sehingga pertumbuhan dapat terekspresi. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi gen GHR-1 Anguilla bicolor dengan metode PCR, dan mengetahui nilai similaritas sekuens gen GHR-1 Anguilla bicolor dibandingkan dengan sekuesn gen yang sama dari spesies ikan lainnya. Gen GHR-1 sidat diisolasi dari hati sidat kemudian diamplifikasi dengan 6 kombinasi primer GHR-1 lalu disekuensing. Analisis sekuens dan filogenetik menunjukkan bagian GHR-1 dari Anguilla bicolor telah berhasil diisolasi dari satu kombinasi primer dengan sekuens parsial 180 bp yang mengkode 59 asam amino. Nilai similaritas sekuens GHR-1 Anguilla bicolor dengan GHR-1 Anguilla japonica adalah 98-100%. Sementara itu, similaritas sekuens GHR-1 Anguilla bicolor dibandingkan dengan spesies ikan lainnya menunjukkan nilai similaritas diatas 50%.
|
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Short-fin Eel (Anguilla bicolor) is an Indonesian fishery commodity that has major export potential but is hindered by its slow growth. Short-fin eel’s growth is influenced by Growth Hormone Receptor I (GHR-I), which functions to capture Growth Hormone (GH) signals so that growth can be expressed. This study was aimed to isolate GHR-1 gene from Anguilla bicolor by the PCR method and determine the similarity value of Anguilla bicolor GHR-1 gene sequence compared to the same gene sequences from other fish species. The GHR-1 gene from Anguilla bicolor was isolated from short-fin eel liver then amplified with 6 combinations of GHR-1 primers and then sequenced. Phylogenetic and sequence analysis showed that GHR-1 gene region of Anguilla bicolor was successfully isolated from one primers combination as partial sequence 180 bp encoding 59 amino acids. The similarity value of GHR-1 gene sequences from Anguilla bicolor with GHR-1 gene sequences from Anguilla japonica was 98-100%. Meanwhile, GHR-1 gene sequences of Anguilla bicolor compared to the other fish species shows similarity values above 50%.
|
|---|
| Kata kunci | Anguilla bicolor, Growth Hormone Receptor I, isolasi gen, sekuensing |
|---|
| Pembimbing 1 | Dr. rer. nat. Hamdan Syakuri, S.Pi., M.Si |
|---|
| Pembimbing 2 | Ir. H. Purnama Sukardi, Ph.D |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2019 |
|---|
| Jumlah Halaman | 18 |
|---|
| Tgl. Entri | 2019-08-21 11:49:37.776352 |
|---|