| NIM | B1B015022 |
|---|
| Namamhs | PERSONA GEMILANG |
|---|
| Judul Artikel | Detection of Wolbachia in Drosophila Mutant |
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Wolbachia adalah mikroorganisme yang dikenal sebagai endosimbion intraseluler pada Arthropoda yang menyebabkan perubahan sifat fenotipik. Efek induksi dari Wolbachia pada inang individu adalah antara lain cytoplasmic incompatibility, partenogenesis, feminisasi, dan male killing. Wolbachia juga menyebabkan popcorn-effect yang dapat mengurangi masa hidup inang dan menyebabkan kematian dini sehingga inang tidak memiliki cukup waktu untuk menularkan penyakit. Berdasarkan potensi ini, Wolbachia memiliki peran penting dalam mengakhiri siklus hidup parasit penyakit yang dibawa oleh vektor. Studi sebelumnya membuktikan bahwa setidaknya 19 spesies lalat buah dari genus Drosophila diinfeksi oleh Wolbachia tetapi tidak ada laporan bahwa mutan Drosophila juga membawa Wolbachia. Oleh karena itu, tujuan dari penelitian ini adalah untuk menentukan keberadaan spesies Wolbachia dalam mutan Drosophila, juga untuk mengetahui urutan basa serta filogeni Wolbachia dalam mutan Drosophila. Penelitian ini menggunakan metode survei yaitu purposive sampling dan deteksi Wolbachia menggunakan PCR, yang menargetkan protein permukaan Wolbachia (wsp). Kehadiran Wolbachia ditentukan berdasarkan pola pita DNA pada gel agarosa. Hubungan filogenetik antara Wolbachia pada mutan Drosophila disimpulkan dari pohon filogenetik. Rekonstruksi pohon filogenetik dilakukan dalam perangkat lunak MEGA berdasarkan metode tetangga-bergabung dan 1000 dukungan bootstrap. Manfaat dari penelitian ini adalah menambahkan database endosimbion serangga. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Wolbachia menginfeksi 7 jenis sampel mutan Drosophila (taksi, ebony, dumpy, miniatur, sepia, white, eye missing). Wolbachia yang menginfeksi sampel merupakan strain Drosophila melanogaster wMel isolate Yunnan outer surface protein precursor (wsp) partial cds dengan kemiripan > 95%. Semua sampel memiliki hubungan genetik terdekat dengan Wolbachia endosymbiont Drosophila melanogaster wMelPop (0%) dan Wolbachia endosymbiont Drosophila simulans wRiv (4%). Semua sampel termasuk dalam supergrup A. |
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Wolbachia is a microorganism known as an intracellular endosymbiont in Arthropods that cause phenotypic changes. The effects of Wolbachia induction on the individual host are cytoplasmic incompatibility, parthenogenesis, feminization, and male killing. Wolbachia is also causing popcorn effect that decreases the life span of a host which leads to early death and not having enough time to transmit disease. Based on this potential, Wolbachia has an important role in terminating the life cycle of the parasite-cause disease that carries by vectors. Previous studies proved that at least 19 species of fruit flies from the genus Drosophila were infected by Wolbachia but there was no report that Drosophila mutants are also carrying Wolbachia. Therefore, the purpose of this study is to determine the presence of Wolbachia species in Drosophila mutants and to know the sequences and phylogeny of Wolbachia in Drosophila mutants. This research uses the survey method with purposive sampling and detection of Wolbachia using PCR, targeting Wolbachia surface protein (wsp). The presence of Wolbachia was determined based on DNA band pattern on the agarose gel. Phylogenetic relationship among Wolbachia in Drosophila mutants was inferred from a phylogenetic tree. Phylogenetic tree reconstruction was done in MEGA software based on neighbor-joining method and 1000 bootstrap support. The benefit of this research is to add a database of insect endosymbiont. The result shows that Wolbachia is present in 7 types of Drosophila mutant samples (taxi, ebony, dumpy, miniature, sepia, white, eye missing) with the strain of Drosophila melanogaster wMel isolate Yunnan outer surface protein precursor (wsp) partial cds with similarity >95%. All of the samples have the nearest genetic relationship with Wolbachia endosymbiont Drosophila melanogaster wMelPop (0%) and Wolbachia endosymbiont Drosophila simulans wRiv (4%). All of the samples are included in supergroup A. |
|---|
| Kata kunci | Wolbachia, mutan Drosophila, sequencing, filogeni, PCR |
|---|
| Pembimbing 1 | Dra. Endang Srimurni Kusmintarsih, SU, P.Hd |
|---|
| Pembimbing 2 | Dr. Agus Nuryanto S.Si, M.Si |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2015 |
|---|
| Jumlah Halaman | 12 |
|---|
| Tgl. Entri | 2019-05-27 11:43:20.092798 |
|---|