| NIM | L1B015005 |
|---|
| Namamhs | ADE PUTRA |
|---|
| Judul Artikel | ISOLASI DAN ANALISIS SEKUEN GEN PROLAKTIN PADA IKAN NILA SRIKANDI (Oreochromis aureus x niloticus) DAN TETUANYA |
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Ikan nila Srikandi (O. aureus x niloticus) merupakan ikan nila hibrid antara ikan nila biru jantan (O. aureus) dan ikan nila Nirwana betina (O. niloticus) yang memiliki toleransi tinggi terhadap salinitas. Gen yang diduga meregulasi kemampuan adaptasi terhadap perubahan salinitas adalah gen tilapia prolaktin (tPRL). Gen tPRL terdiri atas dua jenis yaitu tPRL1 dan tPRL2. Tujuan penelitian ini yaitu untuk melakukan isolasi dan mengetahui hasil direct alignment basa nukleotida dan residu asam amino sekuen parsial gen prolaktin (tPRL1 dan tPRL2) pada ikan nila Srikandi dan tetuanya. RNA total diisolasi dari kelenjar hipofisa dan amplifikasi gen berhasil dilakukan dengan menggunakan primer spesifik untuk gen tPRL1 dan tPRL2. Proses untuk mengetahui susunan basa nukleotida produk amplifikasi berhasil dilakukan. Analisis sekuen yang dilakukan dengan menggunakan fasilitas BLAST baik basa nukleotida maupun residu asam aminonya menunjukkan bahwa keberadaan gen target dapat terkonfirmasi pada semua sampel. Berdasarkan analisis direct alignment gen tPRL1 ikan nila Srikandi memiliki kemiripan tertinggi dengan gen tPRL1 ikan nila aureus, sedangkan gen tPRL2 ikan nila Srikandi memiliki kemiripan yang tinggi dengan ikan nila aureus dan ikan nila Nirwana.
|
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Srikandi tilapia (O. aureus x niloticus) is a hybrid tilapia species from male blue tilapia (O. aureus) and female Nirwana tilapia (O. niloticus) which is have a wide salinity tolerance. Tilapia prolactin (tPRL) genes are expected as the genes that regulate the adaptability in salinity changes. There are two types of tPRL genes, that are tPRL1 and tPRL2. The purposes of this research were to isolate and find out the results of direct alignment of nucleotide bases and amino acid residues in partial sequences of prolactin genes (tPRL1 and tPRL2) in Srikandi tilapia and their pure species. Sample of total RNA was isolated from the pituitary gland and genes amplification was successfully done using specific primers for the tPRL1 and tPRL2 genes. The amplification product was sequenced. The nucleotide bases and amino acid residues were analysed by BLAST. The result of both showed that the presence of targeted genes has been confirmed for all samples. Based on the direct alignment analysis, the tPRL1 gene of Srikandi tilapia has the highest similarity with the tPRL1 gene of aureus tilapia, while the tPRL2 gene of Srikandi tilapia has a high similarity with the tPRL2 gene of aureus tilapia and Nirwana tilapia.
|
|---|
| Kata kunci | Kata kunci: Isolasi gen; sekuensing; basa nukleotida; asam amino. |
|---|
| Pembimbing 1 | Dr. rer. nat. Hamdan Syakuri, S.Pi. M. Si. |
|---|
| Pembimbing 2 | Dr. lmron, S.Pi. M.Si. |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2019 |
|---|
| Jumlah Halaman | 30 |
|---|
| Tgl. Entri | 2019-05-21 00:44:27.778764 |
|---|