| NIM | B2A015004 |
| Namamhs | ANITA DWI ANGGRAINI |
| Judul Artikel | ANALISIS POLIMORFISME GEN COA (KOAGULASE) DENGAN SITUS RESTRIKSI AluI ISOLAT Staphylococcus aureus RESISTEN METHICILLIN |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Analisis polimorfisme suatu gen penting dilakukan untuk memperoleh informasi lebih awal dalam identifikasi penanda genetik yang berhubungan dengan sifat yang ingin dilihat. Metode RFLP menjadi salah satu metode yang dipilih karena dapat melihat polimorfisme urutan DNA yang dapat dideteksi melalui adanya perbedaan fragmen DNA setelah dipotong dengan menggunakan enzim endonuklease tertentu sehingga mampu menggambarkan polimorfisme dari suatu gen. Penelitian dilakukan secara deskriptif dengan tujuan untuk mengetahui adanya polimorfisme gen koagulase S. aureus resisten methichillin. Penelitian ini dilakukan secara deskriptif yang dimaksudkan untuk mengetahui polimorfisme gen coagulase dari methichillin-tahan S. aureus. Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Mikrobiologi Analis Kesehatan Poltekkes Kemenkes Surabaya dan laboratorium Human Genetic di Lembaga Penyakit Tropis Universitas Airlangga Surabaya. Sampel dari penelitian ini diperoleh dari koleksi isolat MRSA di laboratorium Mikrobiologi RSUD Dr. Soetomo Surabaya yang dipilih secara consecutive sampling. Hasil pemeriksaan bakteriologis ke 25 isolat sampel adalah S. aureus dan hasil dari amplifikasi DNA memperlihatkan produk PCR (amplikon) dari gen mecA dan coA dari primer spesifik yang berukuran 304 pb dan 756 pb memiliki positivitas sebesar 100%. Hasil dari PCR-RFLP gen coA juga menunjukkan ke 25 sampel terbagi menjadi 4 pola RFLP dan pola RFLP I (yang tidak terdigesti oleh enzim restriksi AluI ) adalah pola yang paling dominan dengan proporsinya sebesar 64%. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Analysis of the polymorphism of a gene is important to obtain early information in identifying genetic markers related to the characteristics to be seen. The RFLP method becomes one of the chosen methods because it can see polymorphism that can be detected by using the different fragments of DNA that have been cut by using endonuclease enzyme so that it is possible to describe the polymorphism of a gene. Application of RFLP in this study was devoted to see the coagulase gene polymorphism of methicillin-resistant S. aureus. Based on the description above, the researcher was interested in conducting the analysis of CoA (coagulase) gene polymorphism with AluI restriction site of methicillin-resistant S. aureus isolates. The results of this study are aimed to be scientific information about the genetic variation of the coagulase gene of methicillin-resistant S. aureus, and as information in the management of diseases related to antibiotic resistance. This was a descriptive study intended to discover the coagulase gene polymorphism of methichillin-resistant S. aureus. The research was conducted in Microbiology Laboratory of Health Analyst Department, Surabaya, and Human Genetic Laboratory of Institute of Tropical Disease of Airlangga University Surabaya. Samples from this study was a collection of isolates of MRSA in Microbiology Laboratory of Dr. Soetomo Hospital Surabaya selected by using consecutive sampling. Based on the bacteriological examination, all of the samples were S. aureus and the results of amplification showed that PCR product (amplicon) of mecA and CoA gene from specific primers, that were 304 bp and 756 bp, had a positivity of 100%. The results of PCR-RFLP of CoA gene showed that all 25 samples underwent polymorphism which was divided into four RFLP patterns and the biggest one was RFLP I pattern (the one which was not digested by AluI restriction enzyme) with a proportion of 64%. |
| Kata kunci | Staphylococcus aureus, coA gene, PCR-RFLP, AluI |
| Pembimbing 1 | Dr. Daniel Joko Wahyono, M.Biomed |
| Pembimbing 2 | Dr. Hendro Pramono, M.Si |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2017 |
| Jumlah Halaman | 6 |
| Tgl. Entri | 2017-06-08 04:07:08.761393 |
|---|