| NIM | H1K012002 |
|---|
| Namamhs | JAMALUDIN |
|---|
| Judul Artikel | DETEKSI GEN PENYANDI PAH Ring – Hydroxilating Dioxygenase (PAH-RHD) PADA BAKTERI HIDROKARBONOKLASTIK DARI PERAIRAN CILACAP DAN SAMUDERA HINDIA |
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Polisiklik aromatik hidrokarbon (PAH) termasuk kedalam kelompok polutan prioritas karena bersifat toksik, mutagenik, karsinogenik dan teratogenik. Proses degradasi polutan ini oleh bakteri aerobik diinisasi oleh enzim yang disebut PAH Ring – Hydroxilating Dioxygenase (PAH-RHD). Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi keberadaan gen penyandi PAH-RHD pada sembilan isolat bakteri yang diisolasi dari Perairan Cilacap dan Samudera Hindia sehingga dapat diketahui bakteri yang berpotensi sebagai pendegradasi PAH. Metode PCR digunakan untuk amplifikasi gen nahAc, nidA dan phnAc menggunakan primer spesifik dan primer degenerate. Gen-gen tersebut merupakan gen penyandi PAH-RHD yang berperan dalam tahap awal biodegradasi naftalena, fenantrena dan pirena. Deteksi gen nahAc berhasil dilakukan pada Bacillus aquimaris S2 berdasarkan posisi pita DNA tunggal. Hasil analisis BLAST menunjukan bahwa gen nahAc pada Bacillus aquimaris S2 memiliki similiaritas 75% dibandingkan dengan gen nahAc dari Staphylococcus sp. KW-07 (Query cover 52%) dan 74% dibandingkan dengan gen nahAc dari beberapa strain Pseudomonas (Query cover 52%). Hal ini memperlihatkan bahwa Bacillus aquimaris S2 berpotensi sebagai pendegradasi naftalena. Gen penyandi PAH-RHD pada isolat lainnya tidak terdeteksi. |
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) include in a group of organic priority pollutants due to their characteristic as toxic, mutagenic, carcinogenic dan teratogenic. Degradation of this polutan by aerobic bacteria initializing by enzyme called PAH Ring – Hydroxilating Dioxygenase (PAH-RHD). The aim of this study was to detect gene encoding PAH-RHD from nine strains bacteria which isolated from Cilacap Coast and Indian Ocean. PCR method was used to amplify nahAc, phnAc and nidA using specific and degenerate primers. These genes are group of gene encoding PAH-RHD which play important role in the first step of naphtalene, phenantrene and pyrene degradation. Gene of nahAc was observed for Bacillus aquimaris S2 based on single band DNA detection in electrophoresis. BLAST analysis result that shown that gene nahAc from Bacillus aquimaris S2 75% similarity with nahAc gene from Staphylococcus sp. KW-07 (Query cover 52%) and 74% with several Pseudomonas strains (Query cover 52%), so this strain has potency as naphtalene-degrader. The genes PAH-RHD from the other strains in this study were not observed. |
|---|
| Kata kunci | Deteksi gen, nahAc, phnAc, nidA, bakteri hidrokarbonoklastik |
|---|
| Pembimbing 1 | Dr. Agung Dhamar Syakti, S.Pi., DEA |
|---|
| Pembimbing 2 | Dr .rer. nat. Hamdan Syakuri, S.Pi., M.Si |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2017 |
|---|
| Jumlah Halaman | 9 |
|---|
| Tgl. Entri | 2017-03-06 19:13:28.031126 |
|---|