| NIM | H1K012009 |
|---|
| Namamhs | FITA TRISTIANI |
|---|
| Judul Artikel | DETEKSI DAN ANALISIS SEKUEN GEN NRPS DAN PKS-I ISOLAT ACTINOMYCETES DARI SEGARA ANAKAN |
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Actinomycetes merupakan sumber potensial dalam eksplorasi metabolit sekunder, mereka bertanggung jawab untuk produksi sekitar setengah dari metabolit sekunder bioaktif yang ditemukan, seperti untuk agen antibiotik, agen antitumor dan enzim. Banyak molekul bioaktif dari Actinomycetes disintesis oleh NRPS (nonribosomal peptide synthetases) dan PKS-I (polyketide synthases). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan gen NRPS dan PKS-I dari isolat Actinomycetes yang diisolasi dari perairan Segara Anakan-Cilacap serta analisis sekuen dari kedua gen tersebut. Isolat Actinomycetes yang digunakan dalam penelitian ini didapatkan dari koleksi Laboratorium Riset Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Jenderal Soedirman. Sampel DNA dari Actinomycetes diisolasi, gen NRPS dan PKS-I dideteksi menggunakan teknik PCR, amplifikasi menghasilkan sekuen, sekuen kemudian dianalisis menggunakan analisis Blast. Sembilan dari hasil PCR dari delapan belas isolat yang diuji terdeteksi memiliki gen NRPS namun berdasarkan hasil analisis Blast, tujuh sekuen yang terkonfirmasi sebagai bagian dari gen NRPS. Dua dari hasil PCR dari tujuh belas isolat yang diuji terdeteksi memiliki gen PKS-I namun berdasarkan hasil analisis Blast, satu sekuen yang terkonfirmasi sebagai bagian dari gen PKS-I. |
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Actinomycetes are the potential resources on exploration of secondary metabolites, they are responsible for the production of about half of the discovered bioactive secondary metabolites, such as antibiotics, antitumor agents and enzymes. Many of the bioactive molecules from Actinomycetes was synthesized by nonribosomal peptide synthetases (NRPS) and polyketide synthases (PKS-I). The purpose of this study was to analyze the presence of NRPS dan PKS-I genes from Actinomycetes isolated from lagoon Cilacap and sequence analysis of NRPS dan PKS-I genes. Actinomycetes isolates were obtained from the collection of fisheries and marine science research laboratory, Jenderal Soedirman University. In this work, DNA sample was isolated from the bacteria, the genes were detected by using PCR technique, amplification product was sequenced, and the sequence was analyzed, using Blast analysis. Based on PCR product nine from eighteen isolates were indicated to have NRPS, however, based on Blast analysis result only seven sequences were confirmed as part of NRPS genes. PCR product two from seventeen isolates indicated to have PKS-I, however, based on Blast analysis result only one sequence was confirmed as part of PKS-I genes. |
|---|
| Kata kunci | Actinomycetes, NRPS, PKS-I. |
|---|
| Pembimbing 1 | Riyanti, S.T., M.Biotech |
|---|
| Pembimbing 2 | Dr. rer. nat. Hamdan Syakuri, M.Si |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2016 |
|---|
| Jumlah Halaman | 15 |
|---|
| Tgl. Entri | 2016-08-03 23:23:24.401263 |
|---|