| NIM | B1J012148 |
|---|
| Namamhs | NOVI ANDARESWARI |
|---|
| Judul Artikel | VARIASI GENETIK IKAN KERAPU SUNU (Plectropomus leopardus Lac.) DI PULAU JANGANG-JANGANGANG BERDASARKAN ANALISIS SEKUEN PARSIAL GEN SITOKROM C OKSIDASE I (COI) |
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Indonesia merupakan negara yang memiliki potensi sumber daya kelautan yang sangat besar, salah satunya ikan kerapu sunu (Plectropomus leopardus). Minat masyarakat pada ikan kerapu sunu meningkat sejalan dengan peningkatan kesejahteraan masyarakat. Ikan kerapu sunu dapat ditemukan di perairan Sulawesi Selatan termasuk di Pulau Jangang-jangangang Kepulauan Spermonde. Penangkapan ikan kerapu sunu di Kepulauan Spermonde menggunakan bom diketahui mencapai 70% dan bius mencapai 26%. Metode penangkapan tersebut dapat menganacam kelestarian sumberdaya ikan kerapu sunu di pulau tersebut. Oleh karena itu, upaya konservasi diperlukan untuk mencegah kelangkaan ikan kerapu sunu, yaitu melalui data tingkat variasi intrapopulasi ikan kerapu sunu di Pulang Jangang-jangangang Data tingkat variasi dapat diperoleh melalui studi variasi genetik menggunakan karakter molekuler seperti gen sitokrom C oksidase I (COI). Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan data tingkat keragaman haplotipe/gen, keragaman nukleotida, dan polimorfisme pada populasi ikan kerapu sunu di Pulau Jangang-jangangang berdasarkan analisis sekuen parsial gen COI. Sampel ikan kerapu sunu yang digunakan dalam penelitian ini merupakan koleksi laboratorium Taksonomi Hewan yang diambil secara insidental sampling. Tahap penelitian ini diawali dengan melakukan ekstraksi DNA sampel dari sirip ikan, amplifikasi fragmen gen COI mtDNA ikan, elektroforesis gel agarosa, DNA sekuensing, pengeditan sekuen menggunakan Bio-Edit dan pendokumentasian. Keragaman genetik ikan kerapu sunu diduga berdasarkan polimorfime gen COI, keragaman haplotipe, dan keragaman nukleotida yang diperoleh dari analisis secara statistik menggunakan AMOVA dengan bantuan software Arlequin. Analisis dengan model K2P menunjukkan bahwa populasi ikan kerapu sunu tersebut memiliki nilai keragaman haplotipe (h) cukup tinggi yaitu sebesar 0,7000 +/- 0,2184 dan nilai keragaman nukleotida (π) rendah yaitu sebesar 0,46% +/- 0,33%. Analisis polimorfisme menunjukkan populasi ikan kerapu sunu tersebut memiliki polimorfisme rendah atau cenderung monomorfik karena presentase situs polimorfik sebesar 1,06%. |
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Indonesia is a country which has very large potential of marine resources, one of them is coral trout grouper (Plectropomus leopardus). Public interest in coral trout grouper increased in line with increased prosperity in both developed countries and emerging countries. Coral trout grouper are found in the waters of South Sulawesi, including the Jangangang-jangang Island, Spermonde Islands. It is known that the way fishermen in the Spermonde Islands using bombs reaches 70% and pushers reached 26%. Therefore, conservation efforts are needed to prevent the scarcity of coral trout grouper. The data rate of coral trout grouper intrapopulasi variation in jangang-jangangang Island required in conservation efforts that fish. Data rate variation can be obtained through the study of genetic variation using molecular characters like genes cytochrome c oxidase I (COI). This study aims to get the data rate haplotype/gene diversity, nucleotide diversity, and polymorphisms in the population on the island of coral trout grouper Jangang-jangangang based sequence analysis of partial gene COI. Samples of coral trout grouper is a collection of Animal Taxonomy laboratory drawn at incidental sampling. This study begins with the extraction of DNA samples from fish fins, mtDNA COI gene fragment amplified fish, agarose gel electrophoresis, DNA sequencing, editing sequences using Bio-Edit and documentation. The genetic diversity of sequences that have been edited and analyzed statistically using analysis of molecular variance (AMOVA) with help of software Arlequin. K2P analysis model showed that the coral trout grouper populations were of the haplotype diversity (h) high at 0.7000 +/- 0.2184 and the value of nucleotide diversity (π) low at 0,46% +/- 0,33%, Polymorphism analysis showed that coral trout grouper populations are monomorphic with a percentage of 1.06% polymorphic site. |
|---|
| Kata kunci | coral trout grouper, DNA sequencing, genetic diversity, cytochrom C oksidase I (COI) genes. |
|---|
| Pembimbing 1 | Dr. Agus Nuryanto, S.Si, M.Si |
|---|
| Pembimbing 2 | Dr. Hendro Pramono, M.S |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2016 |
|---|
| Jumlah Halaman | 46 |
|---|
| Tgl. Entri | 2016-07-21 07:14:58.659952 |
|---|