Artikel Ilmiah : B1J012037 a.n. ALFIK INDARTO
| NIM | B1J012037 |
|---|---|
| Namamhs | ALFIK INDARTO |
| Judul Artikel | PERANCANGAN PRIMER GEN PENYANDI ENZIM SUKROSA SINTASE PADA UBI JALAR |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Ubi jalar merupakan salah satu anggota suku Convolvulaceae (kangkung-kangkungan) yang dapat dimanfaatkan sebagai bahan pangan karena mengandung karbohidrat dalam jumlah yang memadai. Berdasarkan hasil survai diketahui bahwa konsumen cenderung memilih ubi jalar yang berasa manis dengan kandungan gula yang berkisar dari 4,5% hingga 8,41%. Sukrosa merupakan komponen utama gula pada ubi jalar, yaitu sebesar 49,92% hingga 92,43%. Salah satu enzim yang sangat berperan dalam metabolisme sukrosa adalah sukrosa sintase. Untuk itu diperlukan data urutan (sekuens) gen penyandi sukrosa sintase dari berbagai spesies tumbuhan yang ada di pangkalan data sebagai dasar untuk melakukan perancangan primer PCR dalam upaya untuk mendapatkan gen penyandi sukrosa sintase dari ubi jalar. Penelitian ini bertujuan untuk merancang primer gen penyandi enzim sukrosa sintase pada ubi jalar dan untuk melakukan amplifikasi fragmen gen penyandi enzim tersebut dengan teknik PCR menggunakan primer hasil perancangan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa primer rancangan merupakan primer degenerate dengan sekuens 5’ AYT TCG CCC ARG AAA ATG TB 3’ sebagai primer forward dan 5’ RCC CAT CAT NTT CAC CAT GG 3’ sebagai primer reverse dengan kualitas dan spesifisitas yang cukup baik. Amplifikasi gen penyandi sukrosa sintase pada ubi jalar menggunakan primer hasil perancangan menunjukkan hasil tiga pita (multiple bands) dengan ukuran 700 bp untuk pita teratas dan sekitar 300-400 bp untuk pita ke dua dan ke tiga. Fragmen berukuran 700 bp diharapkan merupakan fragmen gen penyandi sukrosa sintase pada ubi jalar. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Sweet potato is one of the family Convolvulaceae members that can be used as foodstuff due to its adequate contents of carbohydrate. Sucrose is the main sugar components in sweet potato, ranging from 49.92% to 92.43%. One of the enzymes playing important role in sucrose metabolism is sucrose synthase, which can be explored at molecular level by detecting the gene encoding it. Therefore, data on the gene sequences from various plant species available in database is needed to design PCR primers for sucrose synthase partial gene from sweet potato. This study aims to design primers for sucrose synthase partial gene from sweet potato and to amplify the partial gene employing PCR technique with the designed primers. Degenerate primers with sequences of 5’ AYT TCG CCC ARG AAA ATG TB 3’ as forward primer and 5’ RCC CAT CAT NTT CAC CAT GG 3’ as reverse primer are obtained with sufficiently good quality and specificity. Amplification of sucrose synthase partial gene from sweet potato using the primers results in multiple bands, where that of 700 bp is at the uppermost and those of about 300 to 400 bp are the second and third bands respectively. Fragment of 700 bp is expected to be putative sucrose synthase partial gene from sweet potato. |
| Kata kunci | ubi jalar, sukrosa sintase, perancangan primer |
| Pembimbing 1 | Dr. Sc. Agr. Nurtjahjo Dwi S, M.App.Sc. |
| Pembimbing 2 | Drs. Agus Hery Susanto, M.S. |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2016 |
| Jumlah Halaman | 7 |
| Tgl. Entri | 2016-07-20 09:40:21.905147 |