Artikel Ilmiah : B1J012008 a.n. WINDRIYANI
| NIM | B1J012008 |
|---|---|
| Namamhs | WINDRIYANI |
| Judul Artikel | AMPLIFIKASI DNA FOSIL POLEN ASAL SITUS LIYANGAN YANG DIEKSTRAK MENGGUNAKAN CTAB DAN KIT |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Polen merupakan organ reproduksi jantan tumbuhan sub divisi Angiospermae dan Gymnospermae. Di Liyangan ditemukan fosil polen dari 7 Familia yaitu: Poaceae, Podocarpaceae, Liliaceae, Myrtaceae, Cyperaceae, Annonaceae dan Magnoliaceae yang terkubur sedimen material vulkanik selama ±1600 tahun. Rekonstruksi keragaman tumbuhan masa lalu dapat di analisis berdasarkan karakter morfologi dan molekuler. Analisis molekuler memiliki akurasi yang lebih tinggi dibandingkan morfologi namun ketersediaan informasi tentang hal tersebut sangat terbatas. Oleh karena itu diperlukan analisis fosil polen berdasarkan marka molekuler. Sebelum ekstraksi DNA fosil polen perlu dilakukan preparasi untuk menghilangkan sedimen. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui kualitas dan kuantitas DNA fosil polen hasil ekstraksi menggunakan CTAB dan Kit dari sampel hasil preparasi BALAR dan Geologi dan amplifikasi DNA hasil ekstraksi menggunakan primer penyela integenik atpB-rbcL melalui teknik PCR. Penelitian ini dilakukan dengan metode survai, meliputi tahapan pengambilan sampel sedimen, preparasi sampel menggunakan metode BALAR dan Geologi, ekstraksi DNA menggunakan metode CTAB dan Kit, pengukuran kualitas dan kuantitas DNA, serta amplifikasi menggunakan primer penyela intergenik atpB-rbcL. Hasil penelitian dari kelima sampel hasil preparasi berdasarkan metode BALAR yang diekstraksi menggunakan CTAB menunjukan konsentrasi DNA antara 314µg/ml sampai 887µg/ml sedangkan yang diekstrak menggunakan Kit antara 382µg/ml sampai 852µg/. Preparasi metode Geologi yang diekstrak menggunakan kedua metode dihasilkan konsentrasi antara 43µg/ml sampai 230µg/ml (CTAB) dan 22 µg/ml sampai 216 µg/ml (Kit). DNA hasil preparasi BALAR yang diekstrak CTAB dan Kit berhasil diamplifikasi menggunakan primer atpB-rbcL dengan ukuran ±600-900bp. Hasil amplifikasi menunjukan DNA yang diperoleh merupakan DNA tumbuhan. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Pollen is a male reproductive organ resulted from microsporocyte formed during meiotic of Angiospermae and Gymnospermae sub divisions. Pollen might survive and become fossils because of sporopolenin on its exine. Within the Liyangan site, there were 7 families of different fossil pollens, namely: Poaceae, Podocarpaceae, Liliaceae, Myrtaceae, Cyperaceae, Annonaceae and Magnoliaceae which buried by volcanic sediment for ±1600 years. Reconstructing ancient plant’s diversities and abundances might be done by analyzing their fossil pollens both morphologically and molecularly. Molecular analysis is known to be more accurate than morphological analysis but its availability is still limited and so becomes a prerequisite to be done. Extraction of fossil pollens need a specific preparation to clean out the fossil pollens from volcanic sediment and other compounds. This research was aimed to know quality and quantity of DNA fossil pollens extracted by the CTAB and genomic DNA mini Kit prepared by methods of BALAR and Geology. DNA amplification was done by applying a PCR technique. A survey method including sampling, preparation according to the BALAR and Geology methods, DNA extraction applying the CTAB and Kit, DNA measurement for its quality and quantity, DNA amplification using intergenic primer of atpB-rbcL. Data show those five samples prepared according to the BALAR and extracted by CTAB method resulted DNA concentrations between 314µg/ml and 887µg/ml; mean while Kit extraction resulted between 382µg/ml and 852µg/ml. Geology preparation and extracted by CTAB and Kit resulted in between 43µg/ml and 230µg/ml (CTAB); 22 µg/ml to 216 µg/ml (Kit). All DNA samples extracted by both methods and prepared by BALAR were well amplified using intergenic primer atpB-rbcL, they were between ±600-900bp. The results showed amplification the DNA obtained is plant’s DNA. |
| Kata kunci | Fossil Pollen, BALAR, Geology, CTAB, Kit, atpB-rbcL. |
| Pembimbing 1 | Dr.Sc.Agr. Nurtjahjo Dwi Sasongko, M.App. Sc. |
| Pembimbing 2 | Saefuddin Aziz, S.Si., M.Si. |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2016 |
| Jumlah Halaman | 1 |
| Tgl. Entri | 2016-04-25 19:41:37.819966 |