| NIM | A1L011122 |
|---|
| Namamhs | MUHAMMAD AZIZ MUSLIM |
|---|
| Judul Artikel | ANALISIS GENETIK PADI DENGAN BERAGAM KANDUNGAN AMILOSA BERDASARKAN MARKA DNA MIKROSATELIT |
|---|
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Beras yang berkualitas dicirikan dengan tekstur nasi yang lekat, tidak keras, putih bersih dan pulen. Tekstur pulen dan tidaknya suatu beras ditentukan oleh perbandingan kandungan dari amilosa dengan amilopektin yang ada di pati. Salah satu cara untuk mengindentifikasi kandungan amilosa pada beras secara dini adalah dengan menggunakan marka molekuler. Melalui teknik molekuler berbasis marka DNA mampu mengkarakterisasi kandungan amilosa dari berbagai kultivar padi secara lebih cepat, efektif, dan akurat serta tidak dipengaruhi faktor lingkungan. Salah satu marka molekuler yang digunakan ialah marka mikrosatelit atau Simple Sequence Repeats (SSRs). Penelitian ini bertujuan untuk : 1). Mengetahui karakteristik molekuler padi dengan kandungan amilosa yang berbeda 2). Mengetahui marka mikrosatelit spesifik penciri karakter genotipe amilosa tinggi atau rendah pada padi 3). Mengetahui kekerabatan antar varietas dan galur padi yang dicoba dalam penelitian. Penelitian dilaksanakan di Labolatorium Pemuliaan Tanaman dan Bioteknologi, Fakultas Pertanian, dan Labolatorium Genetika Molekuler, Fakultas Biologi, Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto. Penelitian dilaksanakan pada bulan Oktober 2014 hingga Maret 2015. Penelitian ini menggunakan 12 primer mikrosatelit (forward dan reverse) serta 13 genotipe padi yang beragam kandungan amilosanya. Variabel yang diamati adalah keberadaan pita DNA yang teramplifikasi pada masing-masing sampel, analisis tingkat polimorfisme (PIC), dan analisis filogenetik. Hasil penelitian menunjukan bahwa 11 primer bersifat polimorfik dengan nilai rata rata PIC 0.423 (kategori informatif sedang), belum menemukan marka mikrosatelit spesifik untuk penciri karakter genotipe amilosa tinggi atau rendah pada padi yang dicoba. Hasil dendogram memperlihatkan bahwa genotip yang dievaluasi terbagi dalam VII (tujuh) klaster dan memiliki hubungan kekerabatan yang bervariasi. |
|---|
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Rice quality is characterized by sticky rice texture, buffy, clean color, and fluffy. Fluffy texture is determined by comparison of amylose content to amylopectin in starch. An effective way to identify rice amylose content at early stage by using molecular markers. Molecular techniques enable us to distinguish genotype with high or low amylose content more quickly, effectively, accurately and is not influenced by environmental factors. An example of the molecular markers commonly used is microsatellite markers or Simple Sequence Repeats (SSRs). This study aims to: 1). Determine molecular character of genotype with high or low amylose content by using microsatellite markers 2). Identify specific primers for characterization of amylose in rice based in DNA microsatellite 3). Identify genetic relationships between tested genotype. Research was conducted in laboratory of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture and Laboratory of Molecular Genetics, Faculty of Biology, Jenderal Soedirman University Purwokerto. The research was started from October 2014 to March 2015. This study used 12 microsatellite primers and 13 genotypes of rice. Content observed variables were presence of amplified DNA bands in each sample, analysis of the level of polymorphism (PIC), and phylogenetic analysis. Results showed that 11 primer is polymorphic with an average value of PIC 0.423, Spesific microsatellite markers to distinguish genotype with high or low amylose content was not found yet. Dendogram tree showed that genotypes are divided into VII (seven) clusters and have a varying degree of relationships. |
|---|
| Kata kunci | amilosa, marka DNA, mikrosatelit, dendogram |
|---|
| Pembimbing 1 | Ir, Suprayogi, M.Sc., Ph.D |
|---|
| Pembimbing 2 | Ir. Kharisun, Ph.D |
|---|
| Pembimbing 3 | |
|---|
| Tahun | 2015 |
|---|
| Jumlah Halaman | 14 |
|---|
| Tgl. Entri | 2015-08-12 23:09:23.047947 |
|---|