Artikel Ilmiah : B1J011086 a.n. SITI NUR AZIZAH
| NIM | B1J011086 |
|---|---|
| Namamhs | SITI NUR AZIZAH |
| Judul Artikel | KARAKTERISASI MOLEKULER IKAN GURAMI SOANG (Osphronemus goramy Lac.) BERBEDA UKURAN MENGGUNAKAN PCR-RFLP GEN SITOKROM C OKSIDASE 1 |
| Abstrak (Bhs. Indonesia) | Ikan gurami (Osprhronemus goramy Lac.) merupakan ikan air tawar yang banyak dibudidayakan di Indonesia, terutama di Pulau Jawa. Gurami soang dipercaya memiliki laju pertumbuhan lebih cepat dibandingkan strain lainnya. Namun, dalam kenyataan, benih yang berasal dari satu cohort (dihasilkan dari satu pemijahan) memiliki ukuran bervariasi dalam umur yang sama. Perbedaan laju pertumbuhan dapat terjadi karena perbedaan kemampuan metabolisme, khususnya respirasi seluler. Perbedaan laju respirasi seluler diduga karena terdapat perbedaan komponen genetik yang dimiliki pada setiap individu dalam satu cohort, khususnya gen sitokrom c oksidase 1 (CO1). Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengetahui apakah terdapat perbedaan marka PCR-RFLP gen CO1 pada ikan gurami soang berbeda ukuran yang berasal dari satu cohort sehingga dapat digunakan untuk menganalisis keragaman genetik. Penelitian ini dilakukan menggunakan metode survey dengan pengambilan sampel secara purposive random sampling. Enzim restriksi yang digunakan sebanyak 4 buah, karakter molekuler dianalisis secara deskriptif berdasarkan kemunculan fragmen RFLP pada gel agarosa. Hasil penelitian menunjukkan monomorfik. HindIII dapat memotong produk PCR pada semua individu, tetapi PstI, BamHI dan EcoRI tidak dapat memotong gen CO1, sehingga variasi genetik pada CO1 tidak dapat dideteksi dengan menggunakan enzim HindIII, Pst1, BamH1 dan EcoR1. Ikan gurami soang berbeda ukuran memiliki alel sama atau homozigot, sehingga nilai heterozigositasnya 0 (nol). Oleh karena itu, gen CO1 pada penelitian ini tidak dapat digunakan sebagai penanda molekuler untuk membedakan gurami soang berbeda ukuran dalam satu cohort. |
| Abtrak (Bhs. Inggris) | Gourami (Osprhronemus goramy Lac.) is a freshwater fish that is widely cultivated in Indonesia, particularly by fish farmer in Java. Soang strain has a faster growth rate than other strains. However, the fry that derived from a single cohort (generated from a single spawning) shows various sizes even in the same age because they have different growth rate. Differences in growth rate may occur due to differences in metabolic capabilities especially cellular respiration. Different rate of respiration can be assumed to be due to differences in the genetic component, especially on their cytochrome c oxidase 1 gene (CO1). Therefore this study aimed to determine whether there are differences in PCR-RFLP marker CO1 gene among different sizes of gourami soang strain from the same cohort so that can be used to analyze genetic diversity. This study used survey method by applying purposive random sampling. Four restriction enzymes were used during the research. Molecular characters were defined descriptively based on the appearance of restriction fragment on agarose gel. The result showed that soang strain which used in this study had monomorphics allele on their CO1-HindIII. PstI, BamHI, and EcoRI, could not cut the PCR products and results no RFLP markers. So that genetic variation in the used CO1 gene fragment could not be detected using HindIII, Pst1, BamH1 and EcoR1 enzymes. The three different sizes of soang strain had similar alleles or homozygous, meaning that heterozigocity value was 0 (zero). Therefore, the CO1 gene in this study could not be used as molecular character to differentiate different sizes of gourami soang strain from the same cohort. |
| Kata kunci | gourami soang strain, PCR-RFLP, genetic diversity, cohort, cytochrome c oxidase 1 gene (CO1). |
| Pembimbing 1 | Dr. Agus Nuryanto, S.Si., M.Si. |
| Pembimbing 2 | Dr. Hendro Pramono, MS. |
| Pembimbing 3 | |
| Tahun | 2015 |
| Jumlah Halaman | 10 |
| Tgl. Entri | 2015-06-27 09:33:27.341764 |