Update Artikelilmiah: 7788

SHOFFIANA NOOR

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Ternak ruminansia menghasilkan gas metan yang berkontribusi terhadap peningkatan efek rumah kaca di atmosfer. Sapi mengeluarkan gas metan tertinggi selama proses fermentasi pakan dalam rumen. Gas metan dihasilkan oleh bakteri metanogen dalam fermentasi anaerob karbohidrat. Bakteri metanogen sulit diperoleh informasi keragamannya karena sulit dikultur. Salah satu teknik molekuler yang dapat digunakan adalah kloning gen 16S rRNA dan sekuensing. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman spesies bakteri metanogen rumen sapi menggunakan teknik kloning gen 16S rRNA dan sekuensing. Metode yang digunakan adalah metode survai. Berdasarkan hasil seleksi klon, diperoleh 51 klon dengan panjang ukuran insert sebesar 800 bp. Hasil sekuensing terhadap insert diperoleh 2 sekuen berbeda, yaitu uncultured bacterium clone 8-3L21 dan uncultured rumen methanogen clone BBS-12 16S ribosomal RNA gene partial sequence dengan similaritas 99% dan 100%. Genus dari sekuen gen 1 dan 3 adalah Prevotella (24%), Clostridium (1,5%),  dan bakteri uncultured lain, sedangkan spesies dari sekuen gen 2 adalah Methanobrevibacter ruminantium (21,83%), M. millerae (29,17%), M. gottschalkii (6,47%), Methanosphaera stadtmanae, dan Methanobacterium alcaliphilum. Penelitian ini memberikan informasi ilmiah tentang keragaman spesies bakteri metanogen rumen sapi yang dapat dijadikan sebagai dasar pengendalian bakteri metanogen rumen sapi.

Kata kunci : metanogen rumen sapi, kloning gen, 16S rRNA

Abtrak (Bhs. Inggris)

Ruminants produce methane gas which contributes to enhanced greenhouse effect in the atmosphere. Cattle issued the highest methane during the fermentation of feed in the rumen. Methane gas produced by methanogen bacteria in carbohydrates anaerobic fermentation. Methanogen bacteria are difficult to obtain diversity information because difficult cultured. One technique can be used is molecular rRNA 16S gene cloning and sequencing. This study aims to determine the species diversity cattle's rumen methanogen bacteria using rRNA 16S gene cloning and sequencing techniques. The method was used survey method. Based on the clones selection results, obtained clones 51 with 800 bp insert size length. The sequencing results of insert obtained 2 different sequences, ie 8-3L21 clone bacterium uncultured and BBS-12 clone methanogens rumen uncultured rRNA 16S gene partial sequence with 99% and 100% similarity. Genus of 1 and 3 gene sequences were Prevotella (24%), Clostridium (1,5%), and other uncultured bacteria, whereas the 2 gene sequences of species was Methanobrevibacter ruminantium (21,83%), M. millerae (29,17%), M. gottschalkii (6,47%), Methanosphaera stadtmanae, and Methanobacterium alcaliphilum. This research provides scientific information about cattle rumen methanogen bacteria species diversity which can be used as a basis for control of cattle rumen methanogen bacteria.

Keywords : cattle rumen methanogens, gene cloning, rRNA 16S

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman