Home
Login.
Artikelilmiahs
48156
Update
HELMALIA PUSPITA
NIM
Judul Artikel
Analisis Keragaman Genetik Populasi Kunyit (Curcuma longa L.) berdasarkan Marka Cytochrome P450 (P450) dan Simple Sequence Repeats (SSR)
Abstrak (Bhs. Indonesia)
Pengembangan kunyit (Curcuma longa L.) yang unggul secara luas dapat dilakukan dengan adanya pengetahuan terkait keragaman genetik pada kunyit yang dapat membantu pemulia dalam mengenali potensi yang ada. Analisis keragaman genetik dapat dilakukan dengan penggunaan marka molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik morfologi 12 aksesi kunyit yang dikumpulkan dari berbagai daerah di Indonesia, mengetahui tingkat efektivitas marka Simple Sequence Repeats (SSR) dan Cytochrome P450 (CYTP450) dalam mengidentifikasi keragaman genetik pada populasi kunyit, serta mengetahui tingkat kekerabatan populasi kunyit. Karakteristik morfologi kunyit diobservasi secara visual dengan didasarkan pada pedoman untuk melakukan tes kekhasan, keseragaman, dan stabilitas pada kunyit yang dikembangkan oleh PPV&FRA (Protection Of Plant Varieties and Farmers Rights Authority) India (2007). Efektivitas marka molekuler diuji dengan memperkirakan nilai Polymorphic Information Content (PIC) berdasarkan hasil skoring pita DNA yang teramplifikasi pada proses PCR. Analisis kekerabatan populasi kunyit dilakukan dengan menggunakan perangkat NTSYSpc versi 2.11a dengan metode Sequential Agglomerative Hierarchical and Nested-Unweighted Pair-Group Method with Arithmetic (SAHN-UPGMA). Berdasarkan analisis, terdapat keragaman karakteristik morfologi pada populasi kunyit yang diujikan. Nilai PIC tertinggi adalah 0,37 (CSSR 38) pada marka SSR dan 0,36 (CYP2C19F/heme2B6) pada marka CYTP450, yang menandakan bahwa kedua marka cukup informatif dalam mengidentifikasi keragaman. Hasil analisis kekerabatan populasi kunyit tersedia dalam bentuk dendogram dengan koefisien kemiripan antar aksesi yang digunakan berkisar antara 0,36-0,87, menandakan keragaman genetik antar aksesi tergolong tinggi dan perbedaan genetik yang luas.
Abtrak (Bhs. Inggris)
The development of superior turmeric (Curcuma longa L.) can be widely carried out with knowledge related to genetic diversity in turmeric which can help breeders in recognizing the existing potential. Genetic diversity analysis can be done using molecular markers. This study aims to determine morphological characteristics of 12 turmeric accessions collected from various regions in Indonesia, the effectiveness level of Simple Sequence Repeats (SSR) and Cytochrome P450 (CYTP450) markers in identifying genetic diversity, and to determine phylogenetic relationship in turmeric populations.Morphological characteristics of turmeric are visually observed based on the guidelines for conducting distinctiveness, uniformity and stability tests on turmeric developed by PPV&FRA (Protection of Plant Varieties and Farmers Rights Authority) India (2007). The effectiveness of the molecular markers used was tested by estimating Polymorphic Information Content (PIC) value based on the results of scoring amplified DNA bands in the PCR process. The phylogenetic analysis of turmeric population was carried out using the NTSYSpc version 2.11a device with the Sequential Agglomerative Hierarchical and Nested-Unweighted Pair-Group Method with Arithmetic (SAHN-UPGMA) method. Based on the results of the analysis, there was a diversity of morphological characteristics in the tested turmeric population. The highest PIC value was 0.37 (CSSR 38) on the SSR marker and 0.36 (CYP2C19F/heme2B6) on the CYTP450 marker, indicating that both markers were quite informative in identifying diversity. The results of phylogenetic analysis of turmeric population are available in the form of a dendogram which shows that the similarity coefficient between the accessions used ranges from 0.36-0.87 which indicates that the genetic diversity between the accessions is relatively high and the genetic differences are wide.
Kata kunci
Pembimbing 1
Pembimbing 2
Pembimbing 3
Tahun
Jumlah Halaman
Save