Home
Login.
Artikelilmiahs
45790
Update
WITA YUNINGSIH
NIM
Judul Artikel
Konstruksi Primer Spesifik untuk Deteksi Gen MYB sebagai Regulator Biosintesis Antosianin Pembentuk Pola Warna pada Aglaonema
Abstrak (Bhs. Indonesia)
Aglaonema merupakan tanaman unik yang memiliki nilai ekonomi tinggi, salah satunya adalah warna merah pada daun Aglaonema. Warna merah daun Aglaonema dipengaruhi oleh akumulasi senyawa antosianin. Faktor transkripsi MYB merupakan regulator yang memiliki peranan penting dalam biosintesis antosianin. Namun, informasi genetik terkait warna daun Aglaonema belum tersedia. Penelitian ini bertujuan untuk mendesain primer spesifik terhadap gen MYB pada Aglaonema sebagai regulator biosintesis antosianin. Isolasi DNA dilakukan dari tanaman Aglaonema Lipstik, Aglaonema Wulandari, dan Aglaonema Donacarmen. Desain primer spesifik menghasilkan 3 primer aMYB1, aMYB2, dan aMYB3 dengan karekteristik primer yang ideal yaitu Tm antara 55-65°C, persentase GC 40-60%, dan hairpin berjumlah 1-3. Primer aMYB1 dapat menghasilkan pita DNA dengan rentang panjang basa 232 bp dan ketebalan pita yang baik. Analisis hasil sekuensing menggunakan pohon filogenetik menunjukkan bahwa sekuens gen yang didapatkan dari primer aMYB1 memiliki nilai bootstrap yang tinggi dengan gen HvMYB sebesar 97%. Jarak genetik antara gen HvMYB dengan sekuens konsensus Aglaonema adalah 0,3. Gen HvMYB dilaporkan mengaktivasi HvMYC2 yang memiliki korelasi kuat dengan ekspresi antosianin pada tanaman.
Abtrak (Bhs. Inggris)
Aglaonema is a unique plant that has high economic value, one of which is the red color of Aglaonema leaves. The red color of Aglaonema leaves is influenced by the accumulation of anthocyanin compounds. The MYB transcription factor is a regulator that has an important role in anthocyanin biosynthesis. However, genetic information regarding Aglaonema leaf color is not yet available. This research aims to design specific primers for the MYB gene in Aglaonema as a regulator of anthocyanin biosynthesis. DNA isolation was carried out from Aglaonema Lipstick, Aglaonema Wulandari, and Aglaonema Donacarmen plants. The specific primer design produced 3 primers aMYB1, aMYB2, and aMYB3 with ideal primer characteristics, namely Tm between 55-65°C, GC percentage of 40-60%, and 1-3 hairpins.The aMYB1 primer can produce DNA bands with a base length of 232 bp and good band thickness. Analysis of sequencing results using a phylogenetic tree showed that the gene sequence obtained from the aMYB1 primer has a high bootstrap value with HvMYB gene of 97%. The genetic distance between HvMYB gene and Aglaonema consensus sequence is 0.3. The HvMYB gene is reported to activate HvMYC2 which has a strong correlation with anthocyanin expression in plants.
Kata kunci
Pembimbing 1
Pembimbing 2
Pembimbing 3
Tahun
Jumlah Halaman
Save