Home
Login.
Artikelilmiahs
45589
Update
NUR HASTANI AYU WARDANI
NIM
Judul Artikel
IDENTIFIKASI MOLEKULER BAKTERI Aeromonas sp. BERDASARKAN GEN 16S rDNA PADA IKAN UDIKAN (Tor sp.) DI SUNGAI PELUS, BANYUMAS
Abstrak (Bhs. Indonesia)
Ikan udikan merupakan salah satu ikan air tawar lokal yang hidup di perairan wilayah Indonesia. Ikan udikan memiliki prospek permintaan cukup tinggi yang menyebabkan populasinya mengalami kepunahan karena sudah jarang ditemukan di alam. Salah satu bakteri patogen yang dapat menyerang ikan udikan adalah Aeromonas sp. yang dapat menyebabkan penyakit MAS. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk mengidentifikasi keberadaan bakteri Aeromonas sp. berdasarkan gen 16S rDNA pada ikan udikan tangkapan Sungai Pelus. Metode penelitian yang digunakan adalah metode observasi dengan teknik pengambilan sampel secara purposive sampling. Bakteri diisolasi dari sampel mukus ikan udikan pada media TSA. Karakteristik morfologi dan gram KOH sampel bakteri diamati dan dicatat. Sampel isolat bakteri gram negatif ditumbuhkan pada media GSP kemudian dikultur pada media TSB. Sampel DNA diisolasi dari sampel bakteri dan gen 16s rDNA diamplifikasi menggunakan primer spesifik. Hasil PCR disekuensing kemudian diidentifikasi menggunakan analisis BLAST. Hasil menunjukkan terdapat isolat bakteri pada mukus ikan udikan di Sungai Pelus dekat dengan Aeromonas hydrophila dan Aeromonas veronii. Isolat bakteri tersebut mempunyai tingkat kemiripan sebesar 99.06%. Isolat bakteri dianggap dapat mewakili spesies sama jika memiliki persamaan sekuens 16s rDNA lebih dari 97% pada saat analisis BLAST.
Abtrak (Bhs. Inggris)
Udikan fish is one of the local freshwater fish that lives in Indonesian territorial waters. Indian fish have the prospect of high demand which will cause their population to become extinct because they are rarely found in nature. One of the pathogenic bacteria that can attack young fish is Aeromonas sp. which can cause MAS disease. This research was carried out with the aim of identifying the presence of Aeromonas sp. bacteria based on the 16S rDNA gene in village fish caught in the Pelus River. The research method used is the observation method with a purposive sampling technique. Bacteria were isolated from udikan fish mucus samples on TSA media. Morphological characteristics and KOH grams of bacterial samples were observed and recorded. Samples of gram-negative bacterial isolates were grown on GSP media and then cultured on TSB media. DNA samples were isolated from bacterial samples and the 16s rDNA gene was amplified using specific primers. The PCR results were sequenced and then identified using BLAST analysis. The results showed that there were bacterial isolates in the mucus of udikan fish in the Pelus River close to Aeromonas hydrophila and Aeromonas veronii. The bacterial isolate has a similarity level of 99.06%. Bacterial isolates are considered to represent the same species if they have a 16s rDNA sequence similarity of more than 97% during BLAST analysis.
Kata kunci
Pembimbing 1
Pembimbing 2
Pembimbing 3
Tahun
Jumlah Halaman
Save