Update Artikelilmiah: 42978

DANDI NURJATI

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Latar belakang : Kanker serviks merupakan kanker yang berkembang di leher rahim. Penyebab utama kanker serviks adalah adanya infeksi human papillomavirus (HPV). Pengobatan utama kanker serviks adalah dengan agen kemoterapi namun adanya metastasis meyebabkan terjadinya kompleksitas dalam pengobatan, sehingga diperlukan eksplorasi pencarian obat baru untuk mengatasi masalah tersebut. Senyawa cucurbitacin E mempunyai potensi antikanker terhadap metastasis kanker serviks. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui target potensial dan profil molekuer docking senyawa cucurbitacin E terhadap metastasis kanker serviks.
Metodologi : Analisis bioinformatika untuk mencari target protein menggunakan database Genecards, STITCH, STRING, Venny 2.1, WebGestalt dan Cytoscape. Analisis molecular docking menggunakan ChemDraw, Autodock Tools, PyMol, AutoDock Vyna dan DS Biovia untuk mencari profil docking senyawa.
Hasil penelitian : Hasil analisis bioinformatika didapatkan 10 target protein yaitu CXCL12, MAPK3, STAT3, GNAI2, GNB1, RHOA, GNAI1, GNB3, CCL2, CCL4. GNB3 tidak memenuhi syarat skrining awal karena tidak ditemukan kristal PDB. CCL2 dan CCL4 tidak dapat dilanjutkan ke tahap penentuan nilai energi ikatan karena memiliki nilai RMSD > 3 Å. Nilai energi ikatan senyawa cucurbitacin E terhadap masing-masing protein yang diperoleh secara molecular docking yaitu CXCL12 -8,4 kkal/mol, STAT3 23,0 kkal/mol, GNAI2 1,0 kkal/mol, GNB1 -5,1 kkal/mol, RHOA -5,6 kkal/mol dan GNAI1 -8,1 kkal/mol.
Kesimpulan : Target protein cucurbitacin E pada metastasis kanker serviks yaitu CXCL12 namun energi ikatan yang terbentuk tidak lebih baik dari ligan natifnya.

Abtrak (Bhs. Inggris)

Background : Cervical cancer is cancer that develops in the cervix. The main cause of cervical cancer is human papillomavirus (HPV) infection. The main treatment for cervical cancer is with chemotherapy agents, but the presence of metastases causes complexity in treatment, so exploration is needed to find new drugs to overcome this problem. The cucurbitacin E compound has anticancer potential against cervical cancer metastases. This study aims to determine the potential target and molecular docking profile of the cucurbitacin E compound against cervical cancer metastasis.
Methodology : Bioinformatics analysis to search for protein targets using Genecards, STITCH, STRING, Venny 2.1, WebGestalt and Cytoscape databases. Molecular docking analysis using ChemDraw, Autodock Tools, PyMol, AutoDock Vyna and DS Biovia to search for compound docking profiles.
Result : The results of bioinformatics analysis showed that there were 10 protein targets, namely CXCL12, MAPK3, STAT3, GNAI2, GNB1, RHOA, GNAI1, GNB3, CCL2, CCL4. GNB3 did not meet the initial screening requirements because no PDB crystals were found. CCL2 and CCL4 cannot proceed to the stage of determining the bond energy value because they have an RMSD value of > 3 Å. The binding energy value of the cucurbitacin E compound to each protein obtained by molecular docking are CXCL12 -8.4 kcal/mol, STAT3 23.0 kcal/mol, GNAI2 1.0 kcal/mol, GNB1 -5.1 kcal/mol , RHOA -5.6 kcal/mol and GNAI1 -8.1 kcal/mol.
Conclusion : The protein targets of cucurbitacin E in cervical cancer metastasis is CXCL12 but the binding energy formed is not better than its native ligand.

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman