Update Artikelilmiah: 42972

NUR FARIDAH

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Strigidae merupakan salah satu famili Ordo Strigiformes yang terus mengalami perubahan taksonomi. Hal ini terjadi akibat adanya revisi taksonomi dan penemuan spesies baru. Perubahan ini dapat berdampak pada sulitnya manajemen konservasi burung hantu. Identifikasi berdasarkan karakter morfologi pada burung hantu sulit dilakukan karena variasi morfologi antar spesies sangat rendah. Oleh karena itu, identifikasi burung hantu secara molekuler perlu dilakukan. Aplikasi DNA barcoding sebagai alat identifikasi hewan memanfaatkan sekuen spesifik DNA mitokondria. Penelitian ini menggunakan sekuen penanda MtDNA Cytochrome C Oxidase Subunit I (COI) dan Cytochrome b (Cytb). Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui keragaman taksonomik spesies burung hantu pada Famili Strigidae menggunakan teknik DNA barcoding. Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Genetika, Pusat Riset Biosistematika dan Evolusi, BRIN selama 10 bulan. Metode penelitian yang digunakan adalah metode kuantitatif  untuk menghitung jarak genetik intra-spesifik dan inter-spesifik serta mengetahui konstruksi filogenetik burung hantu famili Strigidae berdasarkan sekuen nukleotida DNA mitokondria Cytb dan COI. Berdasarkan hasil penelitian hanya terdapat 7 sampel yang dapat digunakan untuk konstruksi filogenetik. Hal ini diduga disebabkan oleh kualitas DNA dan hasil sekuening yang buruk. Sampel AG 7305, AG 788, dan AG 1796 terkonfirmasi sebagai spesies Otus angelinae, Ketupa ketupu, dan Ketupa ketupu berdasarkan hasil BLAST dengan nilai similaritas 99,60%, 98,76%, dan 98,74%, query cover 96%, 100%, dan 100%, serta e-value untuk ketiga sampel tersebut sebesar 0,0. Sampel AG 706, 743, 713, dan 777 memiliki nilai similaritas dibawah 97%. Terdapat inkonsistensi percabangan O. lempiji dan O. angelinae pada konstruksi filogenetik Cytb dan COI dengan jarak genetik pada Cytb sebesar 10% dan COI sebesar 0,2%. Berdasarkan konstruksi filogenetik Cytb O. angelinae dan O. lettia monofiletik dengan nilai jarak genetik 3,6% sedangkan pada COI O. angelinae monofiletik dengan O. lempiji serta memiliki nilai jarak genetik sebesar 0,2%. Genus Bubo berkerabat dekat dengan genus Ketupa.

Abtrak (Bhs. Inggris)

Strigidae is one of the families of Strigiformes Order which undergo continuous taxonomic changes. This happened due to taxonomy revisions and the discovery of new species. These changes make owl conservation management become challenging. Owls identification based on morphological characters is difficult to apply due to the low morphological variation among species. Therefore, molecular identification of owls could be the solution. The application of DNA barcoding as an animal identification tool utilizes specific mitochondrial DNA sequences. This study used the MtDNA marker sequences Cytochrome C Oxidase Subunit I (COI) and Cytochrome b (Cytb). The aim of this research is to determine the taxonomic diversity of owl species in the Strigidae family using DNA barcoding techniques. This research was carried out at the Genetics Laboratory, Research Centre for Biosystematics and Evolution, BRIN for ten months. The research method used is a quantitative method to calculate intraspecific and interspecific genetic distances and determine the phylogenetic construction of Strigidae family based on the MtDNA marker sequences Cytb and COI. Based on the results, there were only 7 samples that could be used to construct a phylogenetic tree. This result could be caused by poor DNA quality and bad sequencing results. Samples AG 7305, AG 788, and AG 1796 were confirmed as Otus angelinae, Ketupa ketupu, and Ketupa ketupu based on BLAST results with similarity values of 99.60%, 98.76%, and 98.74%, query cover 96%, 100 %, and 100%, and the e-value for the three samples is 0.0. Samples AG 706, 743, 713, and 777 have similarity values below 97%. There is an inconsistent result of Otus lempiji and O. angelinae in the phylogenetic construction of Cytb and COI with a genetic distance in Cytb is 10% and COI is 0,2%. Based on the phylogenetic construction of Cytb O. angelinae is monophyly with O. lettia with a genetic distance value of 3.6%, while in COI O. angelinae is monophyly with O. lempiji with a genetic distance value of 0.2%. The genus Bubo is closely related to the genus Ketupa.

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman