Update Artikelilmiah: 42641

SAVIRA RIZKY DAMAYANTI

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Resistensi antimikroba termasuk dalam 10 besar ancaman kesehatan global yang dapat diatasi salah satunya dengan eksplorasi senyawa bioaktif dari bakteri laut. Namun, masih dijumpai kendala dalam eksplorasi metabolit sekunder pada bakteri yaitu terdapat BGC yang “silent”. Dalam hal itu, pendekatan OSMAC diperlukan untuk mengaktifkannya dengan melakukan variasi parameter pertumbuhan. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi senyawa antibakteri pada Algoriphagus sp. PAP 12 dengan variasi media dan pelarut menggunakan LC-HRMS melalui analisis molecular networking dan dilanjutkan dengan uji antibakteri secara in vitro. Bakteri Algoriphagus sp. PAP 12 dilakukan pre-culture menggunakan media MB. Kemudian dikultur pada variasi 5 media yaitu A1BFe+C, LB, NB, RL1, dan air laut. Ekstraksi bertingkat dengan metode maserasi menggunakan EtOAc dan MeOH. Selanjutnya ekstrak diuji menggunakan LC-HRMS untuk mendeteksi senyawa yang terdereplikasi. Kemudian dilakukan analisis molecular networking melalui GNPS dan diuji aktivitas antibakteri terhadap M. luteus dan E. coli dengan metode difusi cakram. Kultur bakteri Algoriphagus sp. PAP.12 yang berpotensi menghasilkan senyawa aktif berdasarkan analisis molecular networking dan menunjukkan aktivitas antibakteri berdasarkan uji antibakteri secara in vitro adalah A1BFe+C, LB, dan RL1 yang diekstraksi pada MeOH serta LB, NB, SW yang diekstraksi pada EtOAc dengan senyawa methyl carnosate, linoleic acid, surfactin C, surfactin_C14, dan humulone yang masing-masing menunjukkan kekuatan daya hambat lemah terhadap M. luteus. Namun demikian, tidak ada ekstrak yang menunjukkan adanya aktivitas antibakteri terhadap E. coli. Penerapan metode OSMAC dengan variasi media dan pelarut pada Algoriphagus sp. PAP 12 menghasilkan 7 senyawa terdereplikasi yang menunjukkan aktivitas antibakteri menurut analisis molecular networking kemudian 5 dari 7 senyawa tersebut aktif ketika diuji antibakteri secara in vitro.

Abtrak (Bhs. Inggris)

Antimicrobial resistance is one of the top 10 global health threats that can be overcome by exploring bioactive compounds from marine bacteria. However, there are still obstacles in the exploration of secondary metabolites in bacteria, namely there are "silent" BGCs. In that case, the OSMAC approach is needed to activate it by varying growth parameters. This study aims to explore antibacterial compounds in Algoriphagus sp. PAP 12 with media and solvent variations using LC-HRMS through molecular networking analysis and continued with in vitro antibacterial tests. Algoriphagus sp. PAP 12 bacteria were pre-cultured using MB media. Then cultured in 5 media variation, i.e. A1BFe + C, LB, NB, RL1, and seawater. Multistage extraction by maceration method using EtOAc and MeOH. Furthermore, the extracts were tested using LC-HRMS to detect dereplicated compounds. Then analysis using molecular networking on GNPS and tested for antibacterial activity against M. luteus and E. coli using disc diffusion method. Algoriphagus sp. PAP.12 bacterial cultures that have the potential to produce active compounds based on molecular networking analysis and show antibacterial activity based on in vitro antibacterial assay are A1BFe+C, LB, and RL1 extracted in MeOH and LB, NB, SW extracted in EtOAc with compounds methyl carnosate, linoleic acid, surfactin C, surfactin_C14, and humulone which each show weak inhibitory strength against M. luteus. However, none of the extracts showed any antibacterial activity against E. coli. The application of the OSMAC method with variations in media and solvent on Algoriphagus sp. PAP 12 produced 7 replicated compounds that showed antibacterial activity according to molecular networking analysis then 5 of the 7 compounds were active when tested for in vitro antibacterial assay.

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman