Home
Login.
Artikelilmiahs
41704
Update
RAYMOND DEVARA
NIM
Judul Artikel
Analisis Bioinformatika Senyawa Andrografolid Sebagai Antikanker Karsinoma Sel Skuamosa Pada Serviks
Abstrak (Bhs. Indonesia)
Kanker menjadi penyebab utama kematian di seluruh dunia dengan permasalahan pada terapinya. Andrografolid, senyawa yang diisolasi dari Andrographis panniculata menunjukkan aktivitas antikanker yang luas. Adanya bioinformatika dapat membantu mengidentifikasi target terapi andrografolid pada kanker serviks. Analisis bioinformatika dilakukan dengan mengiriskan gen kanker dan gen yang diregulasi andrografolid, analisis geneontology, analisis KEGG pathway dan molecular docking. Delapan puluh tiga target gen potensial terdientifikasi dan analisis geneontology dan KEGG pathway menguak keterlibatannya dalam kanker. Studi literatur mengerucutkan gen lebih lanjut dengan 3 kandidat gen untuk docking yaitu MAPK3, MMP9 dan JAK2. Energi ikatan antara andrografolid dengan MAPK3, MMP9 dan JAK2 dalam kkal/mol berturut-turut adalah -9,954, -9,470 dan -8,482, sedangkan kontrol didapatkan -10,050, -9,459 dan -9,422. Andrografolid berinteraksi dengan beberapa asam amino kunci, yaitu Ile48 dan Tyr53 pada MAPK3, His230, His236, Pro246 dan Met247 pada MMP9 dan Leu983 pada JAK2.
Abtrak (Bhs. Inggris)
Cancer is the world’s leading cause of death with a few drawbacks in its treatment. Andrographolide, a natural substance isolated from Andrographis panniculata has been shown to have broad anticancer activity. Bioinformatics can help identify andrographolide’s therapeutic target in cervical cancer. Bioinformatics analysis was done by intersecting cancer genes and genes regulated by andrographolide, geneontology analysis, KEGG pathway analysis and molecular docking. Eighty three potential target genes were identified and geneontology and KEGG pathway analysis revelaed their role in cancer. Literature study further narrowed 3 genes probable to be docked, MAPK3, MMP9 and JAK2. Binding energies in kcal/mol between andrographolide and MAPK3, MMP9 and JAK2 were -9,954, -9,470 and -8,842 respectively, while control binding energy were -10,050, -9,459 and -9,422. Andrographolide was shown to interact with key amino acid, Ile48 and Tyr53 in MAPK3, His230, His236, Pro246 and Met247 in MMP9 and Leu983 in JAK2.
Kata kunci
Pembimbing 1
Pembimbing 2
Pembimbing 3
Tahun
Jumlah Halaman
Save