Update Artikelilmiah: 41059

JOHANES DE BRITTO BINTAN CAHYO ADI

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Persebaran dan konektivitas populasi C. mitella di Indonesia, khususnya di Kepulauan Maluku, belum banyak dilaporkan sehingga perlu dilakukan penelitian untuk mendukung ketersediaan data genetik yang dibutuhkan untuk pengembangan penelitian selanjutnya. Pendekatan secara molekuler diperlukan pada studi konektivitas populasi untuk menghindari bias faktor lingkungan. Salah satu marka molekuler yang biasa digunakan dalam studi genetika populasi hewan adalah sitokrom oksidase I (COI). Sampel C. mitella diambil secara acak dari enam lokasi yaitu Saparua, Morella, Tawiri, Dermaga Liang, Wakasihu, dan Pantai Akarica Ternate. Secara garis besar, prosedur penelitian terdiri atas ekstraksi DNA genomik menggunakan Qiagen Blood and Tissue Kit serta amplifikasi dan sekuensing marka COI. Marka COI mengunakan sepasang primer universal, yaitu FSrCOI (5’- CAG CAA TAG TTG GGA CAG CTC -3’) dan RSrCOI (5’- CTC CGG CTA AAA CTG GTA AGG -3’). Sekuensing marka COI dilakukan dengan metode dideoksi Sanger yang diotomasi dengan pelabelan pada terminator. Hasil penelitian menunjukkan nilai diversitas haplotipe dari 18 sampel yang di dapat sebesar 1 pada seluruh sampel, kecuali pada sampel Saparua sebesar 0.67. Sementara itu, nilai diversitas nukleotida pada semua sampel lebih kecil dari 0.5. Nilai indeks fiksasi (Fst) tertinggi diperoleh antara Ternate dan Saparua, yakni sebesar 0.31081. Secara keseluruhan didapatkan nilai Fst yang rendah. Pohon filogeni yang terbentuk menunjukkan perbedaan klade populasi Perairan Maluku dari populasi Cina, Taiwan, dan Korea. Berdasarkan hasil penelitian tersebut dapat disimpulkan bahwa terdapat hubungan kekerabatan genetik yang dekat di antara haplotipe-haplotipe yang ditemukan, tidak ada hubungan antara jarak genetik dan jarak geografis pada populasi C. mitella di Perairan Maluku karena adanya konektivitas yang tinggi di antara semua lokasi pengambilan sampel, dan populasi C. mitella di Perairan Maluku tidak memiliki hubungan evolusi dengan populasi C. mitella di Cina, Taiwan, dan Korea.

Abtrak (Bhs. Inggris)

The distribution and connectivity of C. mitella populations in Indonesia, especially in the Maluku Islands, has not been widely reported, so research is needed to support the availability of genetic data needed for further research development. A molecular approach is needed in population connectivity studies to avoid environmental factor bias. One of the molecular markers commonly used in animal population genetic studies is cytochrome oxidase I (COI). Samples of C. mitella were taken randomly from six locations, namely Saparua, Morella, Tawiri, Liang Pier, Wakasihu, and Akarica Ternate Beach. Broadly speaking, the research procedure consisted of extraction of genomic DNA using the Qiagen Blood and Tissue Kit as well as amplification and sequencing of COI markers. The COI marker uses a pair of universal primers, namely FSrCOI (5'- CAG CAA TAG TTG GGA CAG CTC -3') and RSrCOI (5'- CTC CGG CTA AAA CTG GTA AGG -3'). COI marker sequencing was carried out using the dideoxy Sanger method which was automated with terminator labeling. The results showed that the haplotype diversity value of the 18 samples obtained was 1 for all samples, except for the Saparua sample, which was 0.67. Meanwhile, the value of nucleotide diversity in all samples was less than 0.5. The highest fixation index (Fst) value was obtained between Ternate and Saparua, which was 0.31081. Overall, a low Fst value was obtained. The phylogenetic tree formed shows the differences in clades of populations of the Maluku Waters from the populations of China, Taiwan and Korea. Based on the results of this study it can be concluded that there is a close genetic relationship between the haplotypes found, there is no relationship between genetic distance and geographical distance in the C. mitella population in Maluku waters due to high connectivity between all sampling locations. and C. mitella populations in Maluku Waters have no evolutionary relationship with C. mitella populations in China, Taiwan, and Korea.

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman