Update Artikelilmiah: 3876

ANISA KARTIKA SARI

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Petani gurami di Bogor membedakan gurami menjadi enam strain berdasarkan daya produksi telur, kecepatan tumbuh, dan ukuran atau bobot maksimal gurami dewasa. Beranekaragamnya strain ikan gurami mendorong perlunya dilakukan penelitian mengenai hubungan kekerabatan genetik di antara strain-strain tersebut dengan menggunakan penanda molekuler RAPD (random amplified polymorphic DNA). Tujuan penelitian ini adalah untuk menentukan primer yang dapat menghasilkan marka RAPD yang konsisten dan polimorfik pada beberapa strain ikan gurami, menentukan marka RAPD spesifik untuk beberapa strain ikan gurami, dan mengetahui hubungan kekerabatan genetik di antara beberapa strain ikan gurami. Objek yang diteliti ialah ikan gurami strain soang, jepang, dan blue saphire. Metode yang digunakan ialah survei dengan teknik pengambilan sampel secara purposive random sampling. DNA genomik total diisolasi menggunakan Genjettm genomic DNA purificationkit (Fermentas), yang kemudian digunakan sebagai templat untuk amplifikasi marka RAPD menggunakan primer  OPA-07, OPA-09, OPA-11, OPA-20, OPAH-01, OPAH-08, OPAH-09, dan OPAC-14. Penentuan keanekaragaman genetik diawali dengan mengubah pola pita RAPD yang bersifat kualitatif menjadi data biner kuantitatif. Analisis hubungan genetik dilakukan menggunakan metode kladistik dengan bantuan piranti lunak PAUP. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari delapan primer tersebut hanya lima primer yang dapat menghasilkan marka RAPD yang konsisten dan polimorfik pada beberapa strain ikan gurami, yaitu OPA-11, OPA-20, OPAH-1, OPAH-8, dan OPAH-9. Marka RAPD spesifik yang dapat digunakan untuk membedakan antarstrain ikan gurami ialah hasil amplifikasi dengan OPA-20 berukuran 786 pb, OPA-20 berukuran 1.176 pb, OPAH-8 berukuran 1.000 pb, dan OPAC-14 berukuran 1.607 pb. Secara filogenetik, marka RAPD tidak dapat digunakan untuk menentukan hubungan kekerabatan genetik antarstrain ikan gurami dengan jelas.

Abtrak (Bhs. Inggris)

Giant gouramy (Osphronemus gouramy Lac.) is a popular fish species in Indonesia, especially in Java and Sumatera as this freshwater fish species has a high economic value of stable price. Fish farmers in Bogor divide giant gouramy into six strains based on egg productivity, growth rate, and maximum weight of the adult. They are soang, jepang, blue saphire, paris, bastar, and porselin. These various strains lead to the need of study on the genetic relationship among them, which can be performed by the use of RAPD (random amplified polymorphic DNA) marker. This study aims to determine primers producing consistent and polymorphic RAPD markers, determine specific RAPD markers, and know the genetic relationship among several giant gouramy strains. The strains used in this study are soang, jepang, and blue saphire. Survey method was applied employing purposive random sampling technique. Total genomic DNA was isolated using Genjettm genomic DNA purification kit (Fermentas), which was then used as template to amplify RAPD markers with primers OPA-07, OPA-09, OPA-11, OPA-20, OPAH-01, OPAH-08, OPAH-09, and OPAC-14. The variables examined were patterns and numbers of specific DNA fragments as the PCR amplification products. Selected primers were determined descriptively on the basis of specific DNA bands appearing on the agarose gel. Genetic diversity was predetermined by changing qualitative band pattern into quantitative binnary data. Genetic relationship was analyzed using cladistic method with PAUP software. The results showed that only five of the eight primers produce consistent and polymorphic RAPD markers, i.e. OPA-11, OPA-20, OPAH-1, OPAH-8, and OPAH-9. Specific RAPD markers which can be used to distinguish several gouramy strains are those amplified with OPA-20 of 786 bp, OPA-20 of 1,176 bp, OPAH-8 of 1,000 bp and OPAC-14 of 1,607 bp. Nervertheless, it was found that RAPD markers cannot be used to clearly determine genetic relationship among gouramy  strains.

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman