Update Artikelilmiah: 38643

ALEXANDER JASON

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Lactuca spp., Asteraceae, yang terdiri dari selada hijau (L. sativa) adalah jenis selada yang paling sering dibudidayakan, sementara itu selada berduri (L. serriola) dan selada liar (L. virosa). Selada hijau (L. sativa) Sementara itu, selada berduri (L. serriola) dan selada liar (L. virosa) merupakan spesies yang belum dibudidayakan. Penelitian pada ke-tiga spesies tanaman tersebut dikaji, baik secara morfologi maupun molekulernya. Data tersebut kemudian digunakan untuk mengelompokkan hubungan kekerabatan ketiga spesies tersebut yang selama ini belum pernah dilaporkan. Pengambilan sampel dilakukan menggunakan metode composite sampling dan dianalisis menggunakan marka RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) menggunakan 8 primer: (OPF-1, OPF-2, OPF-3, OPF-4, OPC-11, OPAE-5, OPA-2, OPAM-7).  Sebelum PCR, DNA Genom diekstraksi dari setiap sampel, mengikuti protokol DNA kit serta diukur kualitas dan jumlahnya. Jumlah pita DNA dihitung untuk polimorfikatau monomorfik. Analisis data pita polimorfik menggunakan software MEGA 6 (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) dengan metode maximum parsimony yang akan menghasilkan cladogram. Berdasarkan hasil penelitian, amplifikasi marka RAPD pada tiga sampel genotipe selada menggunakan 8 primer acak mengamplifikasi 91 amplikon, 84 diantaranya polimorfik (86,597%) dan tujuh monomorfik. Primer yang menghasilkan persentase polimorfik terbesar adalah OPF-1, OPF-4, OPC-11, OPAE-5, dan OPA-2 (100%), sedangkan primer yang menghasilkan jumlah pita terbanyak adalah OPAM-7 (20 amplikon). Hubungan kekerabatan tiga spesies tanaman selada menunjukkan bahwa spesies L. serriola dan L. virosa memiliki kekerabatan yang paling dekat. Kladogram hasil maximum parsimony terbagi menjadi dua klad utama, yaitu klad I dan klad II. Klad I terdiri dari L. serriola dan L. virosa, klad II terdiri dari L. sativa.

Abtrak (Bhs. Inggris)

Lactuca spp., Asteraceae, like: Green lettuce (L. sativa) is the most common type of lettuce grown, while the spiny lettuce (L. serriola) and wild lettuce (L. virosa) have not been being cultivated yet. The current study explores those three species in morphological and molecular characters. The data are then used to cluster the kinship of them which never been reported so far. Sampling was done in a composite sampling method, and analyzed by RAPD-PCR (Random Amplified Polymorphic DNA) applying 8 primers as follows: (OPF-1, OPF-2, OPF-3, OPF-4, OPC-11, OPAE-5, OPA-2, OPAM-7). Before PCR, the genomic DNA was extracted from each sample, following the DNA kit protocol and measured for their qualities and quantities. The total number of DNA bands were calculated for polymorphic or monomorphic patterns. The polymorphic bands were analyzed by the MEGA 6 software (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) applying a maximum parsimony method to obtain the cladogram of the samples. The RAPD-PCR obtained a total of 91 amplicons where 84 of them are polymorphic (86,597%) and the rest were monomorphic. Primers whch produced the highest polymorphism are OPF-1, OPF-4, OPC-11, OPAE-5, dan OPA-2 (100%), and the OPAM-7 produced the ost amplicons 20 DNA bands. The kinship among these three species showed that L. serriola and L. virosa have the closest distance. The cladogram following the maximum parsimony analysis grouyped them into two clad i.e; clad I and clad II. Clad I consists of L. serriola and L. virosa, clad II consists of L. sativa only.

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman