Home
Login.
Artikelilmiahs
38286
Update
DAVID LODEWYK HAMONANGAN HAMORAY
NIM
Judul Artikel
ANALISIS PROTEIN TARGET DARI ACETOGENINS, ANNONACIN DAN ANNOMURICIN E SEBAGAI ANTIMETASTASIS KANKER PAYUDARA SECARA BIOINFORMATIKA
Abstrak (Bhs. Indonesia)
Metastasis adalah penyebaran sel kanker dari tumor ke jaringan terdekat atau organ lain. Pengobatan kanker payudara yang sudah bermetastasis menggunakan olaparib dan talazoparib menunjukkan beberapa efek samping. Berdasarkan hal itu, diperlukan obat yang dapat mengatasi permasalahan salah satunya dengan bahan alam. Bahan alam yang memiki potensi adalah tanaman sirsak (Annona muricata). Annona muricata memiliki kandungan senyawa seperti annonacin, annomuricin E, dan acetogenins yang telah dilaporkan memiliki aktivitas antikanker pada kanker endometrium, ovarium, dan kolon. Sehingga, diperlukan kajian lebih lanjut terkait potensi ketiga senyawa tersebut sebagai obat antimetastasis kanker payudara. Penelusuran data dilakukan dengan menggunakan PubMed, STITCH, STRING, dan PDB. Data yang didapatkan dari STITCH dan STRING dibandingkan dengan data regulasi kanker payudara. Interaksi dari tiap protein diliat dari STRING dan Cytoscape untuk melihat top 10. Protein yang potensial dilakukan simulasi docking untuk melihat interaksi antara protein dan senyawa. Target potensial dari acetogenins, annonacin dan annomuricin E yaitu VEGFA, ErbB2, EGFR, KDR, JUN, Src, GRB2, SHC1, ITGB1, TP53. VEGFA, EGFR dan ErbB2 menjadi protein yang potensial ditargetkan ketiga senyawa tersebut karena merupakan protein penting dalam invasi, migrasi dan metastasis kanker payudara. Hasil penambatan molekuler menunjukkan acetogenins senyawa paling potensial berdasarkan energi ikatannya pada ErbB2 lebih kuat dari energi ikatan kontrol dibanding senyawa lainnya yaitu -8,7 kkal/mol. Acetogenins mengikat residu asam amino tertentu pada sisi aktif ErbB2. Acetogenins merupakan senyawa yang paling potensial sebagai antimetastasis kanker payudara berdasarkan energi ikatannya. Acetogenins sebagai antimetastasis kanker payudara dengan menargetkan EGFR dan ErbB2.
Abtrak (Bhs. Inggris)
Metastatic is the spread of cancer cells from a tumor to nearby tissues or other organs. Treatment of metastastic breast cancer using olaparib and talazoparib showed some side effects. Based on that, drugs that can overcome the problem are needed, one of which is with natural ingredients. Natural ingredients that have potential are soursop plants (Annona muricata). Annona muricata extract contains compounds such as annonacin, annomuricin E, and acetogenins that have previously been reported to have anticancer activity in endometrial, ovarian, and colon cancer. Thus, further studies are needed regarding the potential of the three compounds as anti-metastatic drugs for breast cancer. Data searches were conducted using PubMed, STITCH, STRING, and PDB. Data obtained from STITCH and STRING were compared with breast cancer regulatory data. The interaction of each protein was looked at from STRING and Cytoscape to see the top 10. The potential proteins were subjected to docking simulation to see the interaction between protein and compound. The potential targets of acetogenins, annonacin and annomuricin E are VEGFA, ErbB2, EGFR, KDR, JUN, Src, GRB2, SHC1, ITGB1, TP53. VEGFA, EGFR and ErbB2 are potential proteins targeted by the three compounds because they are important proteins in breast cancer invasion, migration and metastasis. Molecular tethering results showed that acetogenins is the most potential compound based on its binding energy to ErbB2 which is stronger than the control binding energy compared to other compounds, namely -8.7 kcal/mol. Acetogenins bind to specific amino acid residues on the active side of ErbB2. Acetogenins are the most potential compounds as breast cancer antimetastatic than other compounds based on their binding energy. Acetogenins as breast cancer antimetastatic by targeting EGFR and ErbB2.
Kata kunci
Pembimbing 1
Pembimbing 2
Pembimbing 3
Tahun
Jumlah Halaman
Save