Update Artikelilmiah: 33491

ADEK SYUKRI NANDA

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Overekspressi reseptor Her-2 merupakan biomarker terjadinya kanker payudara, sehingga reseptor ini target dalam pengembangan obat kanker. Senyawa turunan kalkon mempunyai potensi bioaktifitas sebagai anti kanker dan penghambat reseptor Her-2. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi senyawa turunan metoksi kalkon sebagai penghambat reseptor Her-2 secara in silico menggunakan penambatan molekuler. Tahapan pertama preparasi protein dan ligan dalam format file pdb dan pdbqt. Validasi metode dengan menambatkan kembali ligan natif kepada protein untuk memperoleh file konfigurasi yang valid berdasarkan nilai RMSD. Penambatan senyawa uji dengan protein dilakukan menggunakan koordinat hasil validasi yang valid. Konformasi dengan energi terendah telah divisualisai. Validasi menunjukkan nilai RMSD 0,885Å. Energi ikatan senyawa metoksi metil kalkon yang diperoleh adalah -9,8 kkal/mol, dan senyawa kontrol lapatinib adalah -7,0 kkal/mol. Residu asam amino yang berperan adalah ASN850; ARG849; VAL734; LEU785; PHE864; MET774; LEU796; LEU852; LYS753; ALA751. Senyawa turunan kalkon metoksi metil kalkon berpotensi sebagai penghambat reseptor Her-2 kanker payudara.

Abtrak (Bhs. Inggris)

The overexpression of the Her-2 receptor is a biomarker of breast cancer, this receptor is a target in the development of cancer drugs. Chalcone-derived compounds have the potential for bioactivity as anti-cancer and inhibitor of the Her-2 receptor. This study aims to determine the potential of methoxy chalcone derivatives which have to inhibit Her-2 protein in silico using molecular docking. First stage of protein and ligand preparation in pdb and pdbqt file formats. Validation of the method by attaching the native ligand back to the protein to obtain a valid configuration file based on the RMSD value. The tethering of the test compound with protein was carried out using valid validation coordinates. The conformation with the lowest energy has been visualized. Validation showed an RMSD value of 0.885Å. The bond energy of the methoxy methyl calcone compound obtained was -9.8 kcal / mol, and the control compound lapatinib was -7.0 kcal / mol. The amino acid residues that play a role are ASN850; ARG849; VAL734; LEU785; PHE864; MET774; LEU796; LEU852; LYS753; ALA751. Methoxy methyl chalcone derivative compound has the potential to inhibit the Her-2 receptor for breast cancer.

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman