Update Artikelilmiah: 26895

SALAM PERMADI

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Kedelai (Glycine max (L) Merr.) merupakan plasma nutfah yang memiliki keanekaragaman genetik cukup tinggi di Indonesia. Hal ini membuka peluang bagi perakitan varietas kedelai lokal yang unggul. Salah satu teknik pemuliaan varietas lokal yang dapat dilakukan adalah seleksi galur murni (pure line selection). Melalui seleksi galur murni varietas lokal diperoleh keanekaragaman galur/genotipe kedelai  dalam populasi. Upaya ini perlu didukung dengan metode analisis molekuler yang tidak dipengaruhi oleh faktor lingkungan. Salah satu marka molekuler yang dapat digunakan adalah marka RAPD (Random Amplified Polimorphic DNA).
Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui polimorfisme tiga galur kedelai, yaitu galur No. 02, No. 76, dan No. 71, hasil seleksi galur murni dari populasi campuran varietas lokal di Banyumas berdasarkan marka RAPD dan mengetahui hubungan kekerabatan galur kedelai tersebut dengan varietas lokal, Slamet dan Grobogan, sebagai pembanding. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Genetika dan Molekuler Fakultas Biologi Universitas Jenderal Soedirman (UNSOED), sedangkan penanaman benih kedelai dilakukan di greenhouse Fakultas Biologi UNSOED. Penelitian dilakukan pada bulan Maret 2019 sampai dengan Juli 2019. 
Metode penelitian yang digunakan adalah survei dengan teknik pengambilan sampel purposive sampling. Tahapan prosedur kerja terdiri atas 1) isolasi DNA genom tanaman kedelai, 2) elektroforesis dan visualisasi DNA hasil isolasi, 3) pengukuran kualitas dan kuantitas DNA hasil isolasi, 4) amplifikasi marka RAPD dengan teknik PCR, dan 5) elektroforesis dan visualisasi hasil PCR. Amplifikasi marka RAPD dilakukan menggunakan 10 primer acak, yaitu OPA-02, OPA-09, OPA-10, OPA-13, OPB-02, OPB-03, OPB 07, dan OPB-11. Analisis kelompok (cluster analysis) dilakukan menggunakan MEGA.10 dengan metode UPGMA
Hasil analisis RAPD menunjukkan bahwa kelima sampel kedelai memiliki tingkat polimorfisme yang rendah, yaitu 17,02%. Primer yang mengamplifikasi lokus polimorfik adalah OPA-02, OPA-09, OPB-02, OPB-04, OPB 07, OPB-11, dan OPB-12. Sementara itu, primer yang mengamplifikasi lokus monomorfik adalah OPA-10, OPA-13, OPB-03 dan OPB-12. Meskipun nilai polimorfisme lokus yang diperoleh rendah, teknik RAPD dapat mendeteksi perbedaan antara galur dan varietas yang digunakan dalam penelitian ini. Hasil analisis klaster menunjukkan bahwa ketiga galur yang diteliti lebih berkerabat dekat dengan varietas lokal Slamet daripada varietas Grobogan.

Abtrak (Bhs. Inggris)

Soybean (Glycine max) germplasm has a high genetic diversity in Indonesia. This condition provides a great opportunity to produce superior local varieties. One of various tehniques for breeding local varieties is the pure line selection. Through the pure line selection of local varieties, genetic diversity of soybean genotipe or line within a population can be obtained. This breeding effort needs to be suported by molecular analysis which is not affected by the enviromental factors. RAPD (Random Amplified Polimorphic DNA) marker is one of various moleculer techniques that can be used. 
This study aimed to asses genetic diversity of three soybean lines, i.e. line No. 02, No. 76, and No 71, obtained from pure line selection from a mixed population of local varieties in Banyumas based on RAPD markers, and to determine the genetic relationship of the soybean lines with local varieties, i.e. Slamet and Grobogan as comparison. The study was conducted at the Genetics and Molecular Laboratory of the Faculty of Biology of Jenderal Soedirman University (UNSOED), while the planting of soybean seeds was carried out in the greenhouse of the Faculty of Biology of UNSOED. The study was conducted in March 2019 to July 2019.
The study was conducted in a survey method with a purposive sampling technique. The molecular works included 1) genomic DNA extraction, 2) electrophoresis and visualization of the isolated DNA, 3) measurement of quality and quantity of isolated DNA, 4) amplification of RAPD markers through PCR technique and 5) electrophoresis and visualization of the PCR products. RAPD analysis was carried out using 10 primers, i.e OPA-02, OPA-09, OPA-10, OPA-13, OPB-02, OPB-03, OPB-04, OPB 07, OPB-11, and OPB-12. Cluster analysis was done using MEGA.10 software with the UPGMA (Unweight Pairwise Group Methode Analysis).
Based on the results of the study, RAPD analysis reveals that the five soybean samples show low level of polymorphism, which is 17,02%.  Primers that produce polymorphic loci include OPA-02, OPA-09, OPB-02, OPB-04, OPB 07, and OPB-11. While, Primers that produce monomorphic loci are OPA-10, OPA-13, OPB-03, and OPB-12. Although polymorphism level is low, the RAPD technique is able to detect differences between lines and cultivars used in this study. The  cluster analysis shows that the three lines in this study have closer-relationship with local variety Slamet than Grobogan.

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman