Update Artikelilmiah: 26371

MUHAMAD FARKHAN YANUAR

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetik 39 aksesi tanaman apel berdasarkan analisis molekuler berbasis SSR. Pelaksanaan penelitian dilakukan di Laboratorium Teknologi Genom, Balai Bioteknologi, Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi, Tangerang Selatan mulai bulan Februari 2019 sampai April 2019. Penelitian ini terdiri dari lima bagian utama, yakni karakterisasi morfologi, isolasi DNA, uji kualitas dan kuantitas DNA, amplifikasi PCR, dan analisis data. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat keragaman pada karakter morfologi, dan analisis kluster menggunakan perangkat lunak TASSEL menunjukkan adanya 12 kelompok berdasarkan karakter panjang dan lebar daun. Uji kemurnian DNA menggunakan elektroforesis gel agarosa 1,5 % yang memperlihatkan tingkat kemurnian DNA yang memenuhi syarat untuk proses PCR. Visualisasi hasil PCR dengan primer SSR menghasilkan pola pita polimorfis. Dendogram 39 aksesi tanaman apel berdasarkan analisis DARwin versi 6 menunjukkan terbentuknya 3 grup  besar yang mengelompok. Kekerabatan paling dekat terdapat pada aksesi MN3 dan MIMN5. Analisis polimorfisme dengan perangkat lunak PowerMarker versi 3.25 menunjukkan bahwa sebanyak 83 alel terdeteksi dengan rata-rata 10,38 alel per penanda. Sebanyak 5 penanda (5 PA, 6 PA, 12 PA, 13 PA, 14 PA) dari 8 penanda yang dievaluasi memiliki nilai PIC>0,5, sehingga penanda ini sangat tepat digunakan untuk menguji keragaman genetik apel.

Abtrak (Bhs. Inggris)

This research aimed to determine genetic diversity of 39 accessions of apple based on SSR molecular analysis. The research was conducted at the Genomic Technology Laboratory, Biotechnology Center, Agency for the Assessment and Application of Technology, South Tangerang from February 2019 to April 2019. The experiment was divided into five main parts, namely morphological characterization, DNA isolation, DNA quantitation, PCR amplification, and data analysis. The results showed that there were variations in morphological characters, and cluster analysis using TASSEl software produced 12 groups based on the character of length and width of the leaves. DNA purity test using 1.5% agarose gel electrophoresis showed that the purity level of sample DNA was suitable for PCR process. Visualization of PCR product with SSR primers showed a polymorphic banding pattern. Dendogram of 39 accessions of apple evaluated based on DARwin version 6 showed the formation of 3 clustered large groups.  The closest kinship was found in the accessions of MN3 and MIMN5. Polymorphism analysis with PowerMarker version 3.25 software showed that 83 alleles were detected with the average of 10.38 alleles per marker. A total of 5 markers (5 PA, 6 PA, 12 PA, 13 PA, 14 PA) from 8 markers evaluated were found to have PIC values> 0.5, so that they were very suitable to be used as markers to test the genetic diversity of apple

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman