Update Artikelilmiah: 23119

WIDYA ESTI PURWANINGTYAS

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Aktinomisetes merupakan bakteri Gram positif yang bersifat aerobik, berbentuk batang filamen dengan hifa bercabang.  Aktinomisetes dikenal karena kemampuannya dalam mensintesis senyawa metabolit sekunder yang dapat bermanfaat sebagai antibiotik, imunosupresan, herbisida, fungisida, insektisida dan antiparasit.  Oleh karena itu aktinomisetes digunakan sebagai fokus dalam eksplorasi senyawa bioaktif baru.  Namun, potensi aktinomisetes dari daerah perakaran mangrove masih sangat  terbatas pengembangannya. Pendekatan secara molekuler diperlukan  dalam usaha pencarian senyawa bioaktif baru yang lebih menghemat tenaga, waktu dan sebagai pelengkap dalam proses skrining secara konvensional. Pendekatan secara molekuler dapat dilakukan melalui deteksi gen NRPS. Gen tersebut bertanggung jawab dalam sistem biosintetik senyawa nonribosomal peptida dan poliketida.  
Tujuan  penelitian ini adalah untuk mengetahui karakter gen NRPS isolat aktinomisetes  asal tanah perakaran mangrove Segara Anakan, Cilacap berdasarkan atas sekuen gen NRPS. Penelitian ini dilaksanakan menggunakan metode survey dengan analisis deskriptif. Parameter yang diamati meliputi parameter utama dan parameter pendukung. Parameter utama yang diamati pada penelitian ini adalah Index Similarity urutan nukleotida gen NRPS aktinomisetes. Parameter pendukung adalah ukuran pita sekuen gen NRPS dan karakter makromorfologi serta mikromorfologi. Hasil sekuening kemudian akan di analisis secara deskriptif  menggunakan program BLAST pada website NCBI .
Hasil penelitian yang diperoleh menunjukkan bahwa 5 isolat aktinomisetes termasuk dalam genus Streptomyces. Gen NRPS isolat E40FS memiliki kemiripan 78% dengan gen NRPS isolat Streptomyces sp. Tue6075 dengan dan diprediksi mampu menghasilkan vancostatine, complestatine, dan enduradin. Gen NRPS isolat B2SCN4 memiliki kemiripan 78% dengan gen NRPS Streptomyces albulus strain CK-15 dan diprediksi mampu menghasilkan arylomycin, laspartomycin dan teleocidin. Gen NRPS isolat C45.10.6 memiliki kemiripan 90% dengan gen NRPS Streptomyces sp. XZH99 dan diprediksi mampu menghasilkan capreomycin  dan bleomycin. Gen NRPS isolat SA38 memiliki kemiripan 77% dengan gen NRPS Streptomyces alfalfae strain ACCC40021 dan diprediksi mampu menghasilkan staurosporine. Gen NRPS isolat E44.10.C memiliki kemiripan 94% dengan gen NRPS Streptomyces rochei yang diprediksi mampu menghasilkan complestatine.

Abtrak (Bhs. Inggris)

Actinomycetes is an aerobic, Gram- positive, filament shaped bacterial with branching hyphae. Actinomycetes is known for its ability to synthesize secondary metabolites which can be useful as antibiotics, herbicides, fungicides, insecticides and antiparasites. Therefore Actinomycetes are used as a focus in exploring new bioactive compounds. However, the potential of Actinomycetes from the mangrove rhizosphere is very limited. Molecular approaches are needed in the exploration for new bioactive compounds that save energy, time and as a complement to conventional screening processes. Molecular approaches can be carried out through the detection of the NRPS gene. The gene is responsible for the biosynthetic system of nonribosomal peptide compounds.
The purpose of this research was to determine the character of the NRPS gene of the Actinomycetes isolate from the mangrove rhizosphere of Segara Anakan, Cilacap based on the NRPS gene sequence. This research was carried out using a survey method with descriptive analysis. Parameters observed include the main parameters and supporting parameters. The main parameter observed in this study was the Index Similarity of the nucleotide sequence of the NRPS Actinomycetes gene. Supporting parameters were the size of the NRPS gene sequence and macromorphology and micromorphology character. The sequencing results analyzed descriptively using the BLAST program on the NCBI website.
The results showed that 5 actinomycetes isolates belonged to the Streptomyces genus. NRPS gene isolate E40FS has 78% similarity with NRPS gene of Streptomyces sp. Tue6075 with and predicted to produce vancostatine, complestatine, and enduradine. NRPS gene isolate B2SCN4 has 78% similarity with the NRPS gene of Streptomyces albulus CK-15 strain and predicted to produce arylomycin, laspartomycin and teleocidin. NRPS gene isolate C45.10.6 has 90% similarity with NRPS gene of Streptomyces sp. XZH99 and predicted to produce capreomycin and bleomycin. NRPS gene isolate SA38 has 77% similarity with NRPS gene of Streptomyces alfalfae strain ACCC40021 and predicted to produce staurosporine. NRPS gene isolate E44.10.C has 94% similarity with NRPS gene of Streptomyces rochei  and predicted  to produce complestatine.

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman