Update Artikelilmiah: 20184

NAUFALIN HUSNA

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji keragaman genetik dan hubungan kekerabatan antar varietas kentang menggunakan primer Random Amplified Polimorphic DNA (RAPD) dan Simple Sequence Repeat (SSR). Penelitian telah dilaksanakan di Laboratorium Pemuliaan Tanaman dan Bioteknologi Fakultas Pertanian Universitas Jenderal Soedirman, mulai November 2016 sampai Juli 2017. Pengambilan sampel daun kentang dilaksanakan di Batur, Banjarnegara dan Dieng, Wonosobo. Variabel pengamatan yang dilakukan pada penelitian ini adalah data kualitatif berupa keberadaan pita DNA yang teramplifikasi dan data kuantitatif berupa angka hasil pengukuran ladder saat elektroforesis dan pengukuran spektrofotometer. Analisis data yang dilakukan pada penelitian ini, yaitu skoring pita DNA yang teramplifikasi, analisis tingkat polimorfisme dengan penentuan Polymorphic Information Content (PIC), dan penentuan analisis filogenetik menggunakan software Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) ver. 6.06 dengan metode Unweighted Pair Group Method with Arithmetic (UPGMA). Hasil penelitian 13 kultivar kentang menunjukkan bahwa tingkat keragaman genetik yang tinggi dengan persentase polimorfik sebesar 67% - 100%, dan nilai PIC dengan keterangan sedang - sangat informatif. Analisis kekerabatan pada 13 kultivar dihasilkan dua klaster utama. Kelompok klaster pertama terdiri atas kultivar Merah, Margahayu, NH1, Gareta, Vega, Klon 17, Granola, MZ, Lokal Dieng, Ungu, NH2, dan Bliss. Kelompok klaster kedua dibentuk oleh kultivar X. Penggunaan primer RAPD dan SSR menghasilkan pita DNA yang  beragam membuktikan bahwa primer RAPD dan SSR dapat digunakan secara spesifik dalam menganalisis hubungan kekerabatan antar kultivar.

Abtrak (Bhs. Inggris)

This study aimed to determine the genetic diversity and phylogenetic relationship between the varieties of potatoes based molecular markers Random Amplified Polimorphic DNA (RAPD) and Simple Sequence Repeat (SSR). This research was conducted at the Laboratory of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture Jenderal Soedirman University,  from December 2016 to June 2017. Potato leaf sample were taken at Batur, Banjarnegara and Dieng, Wonosobo. Observed variable in this study were qualitative data which were presence of amplified DNA and quantitative data were results of numeric measurement ladder and spectrophotometer. Data analysis performed in this study was the DNA band amplification scoring, analysis of polymorphism by determining level of Polymorphic Information Content (PIC), and determination of phylogenetic analysis using software Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) ver. 6:06 with Unweighted Pair Group Method with Arithmetic (UPGMA) method. The results showed from 13 potato’s varieties, there were high genetic diversity that showed by 67% - 100% percentage of polymorphic and moderate – high informative PIC value. From genetic relationship analyzing of 13 cultivars, its generated two main clusters. First cluster group were Merah, Margahayu, NH1, Gareta, Vega, Klon 17, Granola, MZ, Lokal Dieng, Ungu, NH2, dan Bliss. Second cluster group were X. Used of RAPD and SSR primer produced diverse DNA bands. It proved that RAPD and SSR primer can used specifically for analyzed genetic relationship between varieties.

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman