Update Artikelilmiah: 12017

AKHMAD IZZUL FARKHI

NIM

Judul Artikel

Abstrak (Bhs. Indonesia)

Beras merah dan beras hitam merupakan bahan pangan pokok yang kaya akan kandungan antosianin. Antosianin adalah zat antioksidan yang bermanfaat untuk mencegah penyakit degeneratif seperti hepatitis, kanker usus, stroke, diabetes mellitus, dan penyakit jantung. Pemuliaan tanaman untuk merakit varietas unggul padi kaya antosianin perlu dilakukan untuk mengurangi jumlah penderita penyakit degeneratif. Seleksi di lapang memiliki banyak keterbatasan dalam memilih genotip yang mempunyai kandungan antosianin tinggi. Seleksi dengan marka DNA mikrosatelit merupakan salah satu alternatif yang dapat digunakan untuk menyeleksi secara cepat dan akurat. Mikrosatelit merupakan marka dengan urutan basa nitrogen sederhana dan berulang-ulang sehingga membentuk motif yang unik dan bersifat kodominan. Penelitian ini bertujuan untuk: 1) mengetahui keragaman sifat kandungan antosianin berdasarkan marka DNA mikrosatelit, 2) mengetahui DNA mikrosatelit yang spesifik untuk penciri genotip dengan sifat kandungan antosanin, 3) mengetahui kekerabatan antar varietas dan galur padi yang dicoba dalam penelitian ini berdasarkan marka DNA mikrosatelit. Penelitian ini dilaksanakan mulai Oktober 2014 sampai Maret 2015 di Laboratorium Pemuliaan Tanaman dan Bioteknologi, Fakultas Pertanian, dan Laboratorium Genetika Molekuler, Fakultas Biologi, Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto.  Penelitian ini menggunakan 13 pasang primer mikrosatelit (forward dan reverse) dan 13 genotip padi yang beragam kandungan antosianinnya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari 13 primer yang diuji menghasilkan 10 primer dengan pola pita DNA yang polimorfik dengan nilai rata-rata PIC sebesar 0,398 serta memperoleh marka spesifik yaitu RM336. Analisis filogenetik menggunakan 10 marka yang polimorfik menunjukkan bahwa genotip-genotip yang diuji terbagi menjadi 11 klaster.

Abtrak (Bhs. Inggris)

Red rice and black rice are categorized into main foods with high anthocyanin content. Anthocyanins are categorized into antioxidant useful for preventing degenerative diseases such as hepatitis, intestine cancer, stroke, diabetes mellitus and heart disease. Plant breeding is necessary in creating rice with rich anthocyanin content in order to reduce the amount of degenerative diseases among people. Field selection have some limitation in selecting genotypes with high athocyanin contents. DNA microsatellite markers selection is one of the alternative which is able to do a fast and accurate selection. Microsatellite is a nitrogent-based marker with repeated sequences forming unique motive and having a codominant. The objectives of this research were to: 1)identify characteristic diversity of  anthocyanin content based on DNA microsatellite markers, 2) identify specific DNA microsatellite as indicators of anthocyanin content, 3) identify philogenetics relationship among varieties and rice line tested in this research based on DNA microsatellite markers. This research was conducted from October 2014 to March 2015 in Laboratory of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, and 
Laboratory of Genetic Molecular, Faculty of Biology, Jenderal Soedirman University, Purwokerto. This research used 13 pair microsatellite primers (forward and reverse) and 13 rice genotypes with various anthocyanin contents.  The result showed that 10 from 13 tested primers produced polymorphics DNA on population with average PIC value of 0,398 and also obtained RM336 as a specific marker. Philogenetic analysis using 10 polymorphics marker showed that tested genotypes are separated into 11 clusters.

Kata kunci

Pembimbing 1

Pembimbing 2

Pembimbing 3

Tahun

Jumlah Halaman